More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5128 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5128  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 		 259 aa  527  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.527063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2241  tryptophan synthase subunit alpha  50.2 
 
 		 253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0338  tryptophan synthase subunit alpha  45.31 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.291967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1661  tryptophan synthase, alpha subunit  35.63 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.342631 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2818  tryptophan synthase, alpha subunit  36.8 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1610  tryptophan synthase subunit alpha  31.91 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  41.92 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0398  tryptophan synthase subunit alpha  32.89 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  31.8 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0373  tryptophan synthase subunit alpha  32.89 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  35.44 
 
 		 262 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  35.44 
 
 		 262 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  35.44 
 
 		 262 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  35.98 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  33.04 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  37.16 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  40.47 
 
 		 302 aa  152  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  35.71 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  33.48 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  36.94 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  35.71 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  35.98 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  38.02 
 
 		 273 aa  149  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  35.98 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  38.05 
 
 		 289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  36.59 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  37.37 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  35.34 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  37.93 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  37.93 
 
 		 255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2089  tryptophan synthase, alpha chain  33.89 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0973  tryptophan synthase subunit alpha  33.18 
 
 		 249 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0144713  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  34.18 
 
 		 265 aa  145  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  32.44 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  36.69 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4899  tryptophan synthase subunit alpha  32.41 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1171  tryptophan synthase subunit alpha  37.98 
 
 		 279 aa  143  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  33.33 
 
 		 671 aa  143  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1536  tryptophan synthase subunit alpha  36.33 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.201624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3037  tryptophan synthase subunit alpha  38.54 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0854  tryptophan synthase, alpha subunit  36.07 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  34.77 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1515  tryptophan synthase subunit alpha  37.88 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.157433  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  38.94 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1275  tryptophan synthase subunit alpha  32.74 
 
 		 247 aa  142  6e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  31.84 
 
 		 280 aa  141  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  39.35 
 
 		 278 aa  141  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3306  tryptophan synthase, alpha subunit  32.6 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.333024  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  33.19 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1523  tryptophan synthase subunit alpha  37.37 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107227 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  39.39 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  31.84 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  30.94 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  37.62 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2455  tryptophan synthase subunit alpha  32.27 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1457  tryptophan synthase subunit alpha  37.37 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  34.76 
 
 		 700 aa  140  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3024  tryptophan synthase subunit alpha  37.56 
 
 		 278 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  34.44 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1273  tryptophan synthase subunit alpha  34.57 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  34.44 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  33.2 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  32.82 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2917  tryptophan synthase subunit alpha  34.11 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.410631  normal  0.883222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  33.19 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2134  tryptophan synthase subunit alpha  37.81 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.713088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  35.25 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0683  tryptophan synthase subunit alpha  31.95 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.550176 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  30.7 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  31.84 
 
 		 261 aa  138  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  38.89 
 
 		 261 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0791  tryptophan synthase subunit alpha  36.82 
 
 		 268 aa  139  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000662896  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  37.04 
 
 		 278 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  33.63 
 
 		 256 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  32.16 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  36.68 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  32.16 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  31.35 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2816  tryptophan synthase, alpha subunit  33.07 
 
 		 296 aa  137  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2408  tryptophan synthase subunit alpha  36.04 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  33.19 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  37.38 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  33.21 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0125  tryptophan synthase subunit alpha  34.17 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02763  tryptophan synthase subunit alpha  33.49 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1690  tryptophan synthase subunit alpha  30.71 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1681  tryptophan synthase subunit alpha  33.65 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2466  tryptophan synthase subunit alpha  36.18 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2706  tryptophan synthase subunit alpha  37.06 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2727  tryptophan synthase subunit alpha  37.24 
 
 		 273 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  29.43 
 
 		 271 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2556  tryptophan synthase, alpha subunit  37.81 
 
 		 266 aa  135  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  32.8 
 
 		 268 aa  135  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  33.92 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>