More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1690 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1690  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 256 aa  502  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  43.25 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  41.56 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  40.35 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  38.67 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  37.12 
 
 		 266 aa  185  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0354  tryptophan synthase subunit alpha  43.18 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  36.88 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  34.5 
 
 		 302 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  38.63 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  35.77 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  38.58 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  35.77 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  38.55 
 
 		 273 aa  179  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 271 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  35.47 
 
 		 274 aa  178  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1275  tryptophan synthase subunit alpha  38.37 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  36.96 
 
 		 268 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  34.78 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  37.31 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  34.36 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  37.96 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  36.89 
 
 		 269 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  35.63 
 
 		 723 aa  174  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3306  tryptophan synthase, alpha subunit  38.26 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.333024  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  37.96 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  35 
 
 		 279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  36.33 
 
 		 269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  36.48 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  36.92 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  36.92 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  37.93 
 
 		 268 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  38 
 
 		 259 aa  171  6.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  36.48 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  38.52 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  43.55 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  37.1 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2138  tryptophan synthase subunit alpha  38.79 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1687  tryptophan synthase subunit alpha  39.19 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.894193  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  37.3 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1025  tryptophan synthase subunit alpha  34.85 
 
 		 266 aa  170  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  hitchhiker  0.000106385 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  38.8 
 
 		 265 aa  169  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  36.05 
 
 		 263 aa  169  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  36.29 
 
 		 263 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  36.29 
 
 		 263 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0973  tryptophan synthase subunit alpha  40.54 
 
 		 249 aa  168  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0144713  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2089  tryptophan synthase, alpha chain  35.32 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  38.08 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  38.31 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  36.47 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01272  tryptophan synthase subunit alpha  36.06 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0398  tryptophan synthase subunit alpha  35.34 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  38.55 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  38.55 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  38.55 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  33.2 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  35.83 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  36.43 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  36.71 
 
 		 279 aa  165  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0373  tryptophan synthase subunit alpha  34.94 
 
 		 249 aa  166  5e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  35.23 
 
 		 268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  35.23 
 
 		 268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  38.15 
 
 		 258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  35.41 
 
 		 275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  37.75 
 
 		 258 aa  165  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1610  tryptophan synthase subunit alpha  35.34 
 
 		 249 aa  165  8e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  35.38 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  39.26 
 
 		 278 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  36.86 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  34.21 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  33.46 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  36.4 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  34.48 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  35.83 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  36.15 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  37.3 
 
 		 280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  35.14 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  35.83 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  36.21 
 
 		 700 aa  163  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  34.98 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  39.26 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  34.18 
 
 		 278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  38.96 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  36.47 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  37.61 
 
 		 278 aa  161  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  37.65 
 
 		 258 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1937  tryptophan synthase, alpha subunit  35.2 
 
 		 269 aa  161  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  33.58 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  37.65 
 
 		 279 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  36.63 
 
 		 270 aa  160  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  34.92 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1424  tryptophan synthase subunit alpha  39.55 
 
 		 267 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  35.14 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  36.84 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  37.15 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  37.25 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  36.92 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  37.64 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1150  tryptophan synthase subunit alpha  36.73 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2177  tryptophan synthase, alpha subunit  35.6 
 
 		 269 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>