More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0373 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0373  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 
249 aa  501  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0398  tryptophan synthase subunit alpha  99.6 
 
 
249 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1610  tryptophan synthase subunit alpha  97.59 
 
 
249 aa  487  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1275  tryptophan synthase subunit alpha  43.95 
 
 
247 aa  237  1e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3306  tryptophan synthase, alpha subunit  45.64 
 
 
252 aa  225  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.333024  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0354  tryptophan synthase subunit alpha  46.12 
 
 
249 aa  222  4e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1687  tryptophan synthase subunit alpha  40.82 
 
 
249 aa  209  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.894193  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0973  tryptophan synthase subunit alpha  40.33 
 
 
249 aa  207  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0144713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  36.89 
 
 
262 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  37.5 
 
 
256 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  34.15 
 
 
257 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 
268 aa  170  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  40.69 
 
 
259 aa  169  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  36.33 
 
 
265 aa  170  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  34.82 
 
 
256 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  37.82 
 
 
263 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1690  tryptophan synthase subunit alpha  34.94 
 
 
256 aa  166  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  33.61 
 
 
260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  34.2 
 
 
265 aa  164  9e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  38.1 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  35.81 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  35.9 
 
 
265 aa  162  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  35.98 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  36.94 
 
 
267 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  37.33 
 
 
255 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  35.32 
 
 
257 aa  160  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2556  tryptophan synthase, alpha subunit  39.64 
 
 
266 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741139  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1434  tryptophan synthase subunit alpha  36.74 
 
 
242 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1463  tryptophan synthase subunit alpha  36.74 
 
 
242 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  35.9 
 
 
266 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  38.26 
 
 
268 aa  158  6e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  35.5 
 
 
278 aa  158  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  33.48 
 
 
258 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2241  tryptophan synthase subunit alpha  31.14 
 
 
253 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5128  tryptophan synthase, alpha subunit  32.89 
 
 
259 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.527063  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1172  tryptophan synthase, alpha chain  36.77 
 
 
258 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  36.12 
 
 
302 aa  157  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  34.08 
 
 
258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  33.93 
 
 
258 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  37 
 
 
280 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  35.84 
 
 
267 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  37.65 
 
 
266 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  34.98 
 
 
271 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  36.28 
 
 
267 aa  154  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  33.63 
 
 
258 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  33.91 
 
 
264 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  33.48 
 
 
258 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  33.04 
 
 
258 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  35.02 
 
 
263 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  35.02 
 
 
263 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  33.48 
 
 
258 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  33.19 
 
 
261 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  33.91 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  35.78 
 
 
280 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  36.12 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  34.67 
 
 
255 aa  152  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  34.67 
 
 
255 aa  152  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3037  tryptophan synthase subunit alpha  34.75 
 
 
276 aa  152  7e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  36.44 
 
 
271 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  36.89 
 
 
266 aa  151  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 
274 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1362  tryptophan synthase subunit alpha  33.18 
 
 
258 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  33.48 
 
 
258 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  34.6 
 
 
267 aa  150  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  34.31 
 
 
265 aa  149  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  32.14 
 
 
258 aa  148  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  32.73 
 
 
267 aa  148  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2138  tryptophan synthase subunit alpha  34.67 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  34.7 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1273  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  36.07 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  31.98 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 
263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1150  tryptophan synthase subunit alpha  31.84 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  32.38 
 
 
269 aa  145  5e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  38.91 
 
 
274 aa  145  5e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2816  tryptophan synthase, alpha subunit  33.19 
 
 
296 aa  145  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1171  tryptophan synthase subunit alpha  34.35 
 
 
279 aa  145  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  34.32 
 
 
272 aa  145  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0403  tryptophan synthase, alpha subunit  35.19 
 
 
246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  34.51 
 
 
267 aa  145  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  39.04 
 
 
254 aa  144  9e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  36.09 
 
 
279 aa  144  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1661  tryptophan synthase, alpha subunit  30.58 
 
 
261 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.342631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  32.34 
 
 
278 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  31.58 
 
 
275 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  32.89 
 
 
278 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  38.64 
 
 
279 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  29.79 
 
 
262 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  33.48 
 
 
267 aa  143  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  38.64 
 
 
279 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0854  tryptophan synthase, alpha subunit  32.62 
 
 
290 aa  143  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2089  tryptophan synthase, alpha chain  30.36 
 
 
263 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  35.09 
 
 
264 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  30.51 
 
 
261 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  32.48 
 
 
279 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1255  tryptophan synthase subunit alpha  34.05 
 
 
267 aa  142  5e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00504507  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  35.24 
 
 
279 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>