More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1434 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1463  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 
242 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1434  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 
242 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0943  tryptophan synthase subunit alpha  62.81 
 
 
243 aa  328  6e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.669087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  41.67 
 
 
258 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  41.25 
 
 
258 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  41.25 
 
 
258 aa  205  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  41.25 
 
 
258 aa  204  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  41.25 
 
 
258 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  41.25 
 
 
258 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  41.67 
 
 
258 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  40.83 
 
 
258 aa  201  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1362  tryptophan synthase subunit alpha  40.83 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1150  tryptophan synthase subunit alpha  39 
 
 
258 aa  195  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  38.93 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1548  tryptophan synthase subunit alpha  37.13 
 
 
253 aa  172  5.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1548  tryptophan synthase subunit alpha  36.44 
 
 
260 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  36.75 
 
 
275 aa  171  9e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  37.84 
 
 
258 aa  170  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  37.61 
 
 
280 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  35.63 
 
 
267 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  35.63 
 
 
267 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  39.82 
 
 
271 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  37.3 
 
 
256 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  35.47 
 
 
280 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  36.44 
 
 
266 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2138  tryptophan synthase subunit alpha  39.82 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  37.66 
 
 
279 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  34.68 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  37.27 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  41.21 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  36.94 
 
 
255 aa  162  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  37.72 
 
 
268 aa  163  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  35.89 
 
 
267 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  36.94 
 
 
255 aa  162  6e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  36.61 
 
 
262 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1610  tryptophan synthase subunit alpha  36.74 
 
 
249 aa  161  9e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0398  tryptophan synthase subunit alpha  36.74 
 
 
249 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  34.16 
 
 
274 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0373  tryptophan synthase subunit alpha  36.74 
 
 
249 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  36.86 
 
 
279 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  35.09 
 
 
267 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  33.88 
 
 
266 aa  158  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  34.7 
 
 
260 aa  158  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  40.35 
 
 
254 aa  158  8e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  35.09 
 
 
266 aa  158  9e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  34.98 
 
 
266 aa  156  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  35.14 
 
 
255 aa  156  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0354  tryptophan synthase subunit alpha  39.19 
 
 
249 aa  156  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  35.89 
 
 
269 aa  155  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  34.82 
 
 
278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  34.01 
 
 
267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  32.52 
 
 
267 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  32.23 
 
 
265 aa  155  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  34.65 
 
 
271 aa  154  9e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1275  tryptophan synthase subunit alpha  35.48 
 
 
247 aa  154  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0125  tryptophan synthase subunit alpha  33.8 
 
 
255 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  34.47 
 
 
267 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  36.8 
 
 
279 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  36.96 
 
 
279 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  33.62 
 
 
267 aa  152  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3306  tryptophan synthase, alpha subunit  35.81 
 
 
252 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.333024  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 
279 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  39.39 
 
 
279 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  34.51 
 
 
271 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1587  tryptophan synthase subunit alpha  35.41 
 
 
255 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000746649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  34.53 
 
 
267 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  39.29 
 
 
265 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  36.68 
 
 
278 aa  150  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  37.39 
 
 
263 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  37.39 
 
 
263 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2466  tryptophan synthase subunit alpha  34.48 
 
 
257 aa  149  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  36.82 
 
 
723 aa  149  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  32.79 
 
 
285 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  39.73 
 
 
277 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1536  tryptophan synthase subunit alpha  33.18 
 
 
262 aa  149  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.201624  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0696  tryptophan synthase, alpha subunit  33.05 
 
 
253 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 
272 aa  148  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  36.99 
 
 
279 aa  148  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  38.57 
 
 
263 aa  148  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  34.8 
 
 
272 aa  148  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  32.64 
 
 
302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  35.38 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  33.2 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  36.94 
 
 
279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  37.39 
 
 
278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  32.39 
 
 
285 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  32.93 
 
 
270 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  32.31 
 
 
267 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3190  tryptophan synthase, alpha subunit  34.73 
 
 
271 aa  145  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  33.48 
 
 
290 aa  145  5e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  35.8 
 
 
263 aa  145  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  32.52 
 
 
257 aa  145  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  33.47 
 
 
267 aa  145  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  39.38 
 
 
278 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  36.18 
 
 
265 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4374  tryptophan synthase, alpha subunit  33.33 
 
 
288 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  34.02 
 
 
275 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  34.07 
 
 
269 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4899  tryptophan synthase subunit alpha  35.78 
 
 
253 aa  143  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  39.13 
 
 
279 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>