More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4374 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4374  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 		 288 aa  590  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  40.55 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  40.55 
 
 		 279 aa  195  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  40.16 
 
 		 279 aa  192  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  45.37 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  40.16 
 
 		 272 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  42.98 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  39.84 
 
 		 256 aa  185  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 278 aa  185  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  39.84 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  39.84 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  42.54 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  41.04 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  42.11 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  39.6 
 
 		 281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  38.66 
 
 		 279 aa  182  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  40.81 
 
 		 265 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  40.15 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  39.61 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  39.2 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  41.56 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  38.41 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  41.85 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 269 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  38.82 
 
 		 278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  40.73 
 
 		 269 aa  179  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  40.97 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  41.48 
 
 		 279 aa  179  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  38.67 
 
 		 261 aa  178  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  41.85 
 
 		 269 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  40.69 
 
 		 277 aa  178  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.85 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  42.54 
 
 		 267 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  39.5 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  38.19 
 
 		 279 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 		 279 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  38.49 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  39.36 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  38.31 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  39.51 
 
 		 270 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  40.81 
 
 		 272 aa  175  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  42.15 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  36.61 
 
 		 264 aa  175  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  36.5 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  37.64 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  36.59 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2138  tryptophan synthase subunit alpha  39.74 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  40.79 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  40.25 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  38.89 
 
 		 263 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  34.51 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  38.5 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  39.65 
 
 		 269 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  39.42 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  39.42 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  39.91 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  39.47 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  39.47 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  38.39 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  36.86 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  36.9 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  36.32 
 
 		 258 aa  169  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  40.81 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 		 275 aa  168  8e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  40.81 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  36.32 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  40.97 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  36.61 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  39.44 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  38.26 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  40.53 
 
 		 272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  38.77 
 
 		 272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4977  tryptophan synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 275 aa  165  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  36.76 
 
 		 272 aa  165  8e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  36.28 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  36.32 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  40.35 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  36.32 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  36.32 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  39.46 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  37.35 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  36.32 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  38.67 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  36.6 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  37.39 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  37.15 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  37.75 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1150  tryptophan synthase subunit alpha  35.84 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  41.13 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  39.82 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  35.87 
 
 		 258 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  38.26 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  39.29 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  36.86 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>