More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0125 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0125  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 255 aa  518  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2466  tryptophan synthase subunit alpha  53.15 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1740  tryptophan synthase subunit alpha  56.13 
 
 		 270 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1536  tryptophan synthase subunit alpha  50.78 
 
 		 262 aa  262  4.999999999999999e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.201624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1587  tryptophan synthase subunit alpha  50.59 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000746649  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3478  tryptophan synthase subunit alpha  49.62 
 
 		 270 aa  246  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.899291  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  36.48 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  39.39 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  41.6 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  37.39 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  35.66 
 
 		 280 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  38.34 
 
 		 263 aa  185  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  39.02 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  34.02 
 
 		 279 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  35.39 
 
 		 271 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  40.27 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  38.27 
 
 		 268 aa  182  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  38.05 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  35.12 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  39.51 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  37.33 
 
 		 258 aa  178  5.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  34.71 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  40.27 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  37.24 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  40.71 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  34.71 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  35.27 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  35.27 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  38.15 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  38.11 
 
 		 269 aa  171  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  37.17 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  38.5 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  37.17 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  35.17 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  38.05 
 
 		 266 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  37.76 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  35.62 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  39.41 
 
 		 269 aa  169  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  35.74 
 
 		 723 aa  166  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  40.26 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  36.93 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  43.64 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  35.02 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  37.93 
 
 		 267 aa  165  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4899  tryptophan synthase subunit alpha  32.77 
 
 		 253 aa  166  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  36.68 
 
 		 257 aa  164  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2241  tryptophan synthase subunit alpha  38.67 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1275  tryptophan synthase subunit alpha  34.01 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3306  tryptophan synthase, alpha subunit  34.22 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.333024  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  34.73 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2089  tryptophan synthase, alpha chain  39.33 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0973  tryptophan synthase subunit alpha  35.34 
 
 		 249 aa  162  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0144713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  37.8 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  36.02 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  35.86 
 
 		 258 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  38.94 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  35.86 
 
 		 258 aa  162  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  38.81 
 
 		 267 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  35.89 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1150  tryptophan synthase subunit alpha  36.29 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  40.79 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  38.94 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  37.97 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  37.92 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  33.47 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  38.91 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  35.89 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  38.2 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  34.68 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  39.21 
 
 		 269 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  34.03 
 
 		 700 aa  159  6e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  39.32 
 
 		 265 aa  158  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1362  tryptophan synthase subunit alpha  35.44 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  35.48 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  35.48 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1965  tryptophan synthase subunit alpha  45.59 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  37.97 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  35.48 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  35.48 
 
 		 258 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0403  tryptophan synthase, alpha subunit  37.44 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1687  tryptophan synthase subunit alpha  34.05 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.894193  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  39.83 
 
 		 271 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  38.1 
 
 		 270 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  39.75 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  34.57 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  35.46 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  38.77 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  39.83 
 
 		 271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  35.95 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  39.82 
 
 		 278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  38.22 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  37.29 
 
 		 306 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>