More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2089 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2089  tryptophan synthase, alpha chain  100 
 
 		 263 aa  506  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  48.78 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  46.72 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  41.5 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  44.76 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  41.5 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  44.02 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  41.5 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  39.84 
 
 		 262 aa  198  7e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  43.55 
 
 		 261 aa  198  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  45.42 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  40.08 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 		 267 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  42.97 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 		 267 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  41.32 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  40.93 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  40.43 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  41.13 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  40.6 
 
 		 267 aa  188  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1150  tryptophan synthase subunit alpha  40.55 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  43.89 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  43.53 
 
 		 268 aa  187  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  39.67 
 
 		 700 aa  186  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  40.32 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  39.3 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  42.92 
 
 		 263 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  42.92 
 
 		 263 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  40.26 
 
 		 279 aa  185  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  39.53 
 
 		 258 aa  185  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  39.53 
 
 		 258 aa  184  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 258 aa  184  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  39.53 
 
 		 258 aa  184  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  39.53 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  44.21 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  39.53 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  40.64 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  40.94 
 
 		 265 aa  182  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1362  tryptophan synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  42.54 
 
 		 266 aa  182  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  45.54 
 
 		 275 aa  181  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  42.45 
 
 		 261 aa  182  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1275  tryptophan synthase subunit alpha  36.11 
 
 		 247 aa  181  9.000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  42.02 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  44.02 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  33.2 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  44.26 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  44.36 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  43.44 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  36.29 
 
 		 262 aa  178  8e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01272  tryptophan synthase subunit alpha  44.71 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  42.54 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  39.48 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  38 
 
 		 275 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  43.02 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  41.5 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  41.5 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  41 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  37.65 
 
 		 265 aa  174  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  36.19 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  41.92 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3306  tryptophan synthase, alpha subunit  33.88 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.333024  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  39.3 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  41.04 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  42.42 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  38.75 
 
 		 671 aa  174  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  37.85 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  40.35 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1690  tryptophan synthase subunit alpha  35.32 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  40.29 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  39.43 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  40.32 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  37.74 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  35.8 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 279 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2466  tryptophan synthase subunit alpha  43.04 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  35.41 
 
 		 280 aa  171  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  40.23 
 
 		 279 aa  171  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1025  tryptophan synthase subunit alpha  43.03 
 
 		 266 aa  171  9e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  hitchhiker  0.000106385 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  43.02 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  41.67 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  39.36 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  38.31 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  43.02 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  42.05 
 
 		 285 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  40.26 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  40.4 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  44.93 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  40.16 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  40.87 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  44.93 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  38.7 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0338  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.291967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>