More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0338 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0338  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.291967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2241  tryptophan synthase subunit alpha  51.19 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5128  tryptophan synthase, alpha subunit  45.31 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.527063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1661  tryptophan synthase, alpha subunit  36.61 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.342631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  41.82 
 
 		 271 aa  178  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 261 aa  175  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  37.34 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  34.57 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  34.8 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  37.28 
 
 		 260 aa  169  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  39.09 
 
 		 267 aa  169  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  38.62 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  39.59 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  38.8 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2818  tryptophan synthase, alpha subunit  37.25 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  37.5 
 
 		 261 aa  164  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  35.62 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  38.91 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  35.62 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  35.62 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  36.09 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2089  tryptophan synthase, alpha chain  38.4 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  37.27 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  34.53 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  35.29 
 
 		 266 aa  158  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 269 aa  158  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  35.95 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  34.6 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  34.08 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  37.61 
 
 		 302 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1362  tryptophan synthase subunit alpha  35.47 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  33.73 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  33.87 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  35.54 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  38.75 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  36.87 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  33.73 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  34.2 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  35.22 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  34.18 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  34.62 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  37.98 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  35.04 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  36.08 
 
 		 269 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  35.06 
 
 		 255 aa  155  8e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  34.98 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1687  tryptophan synthase subunit alpha  36.07 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.894193  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  35.84 
 
 		 700 aa  153  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  38.05 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  34.66 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  34.78 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2816  tryptophan synthase, alpha subunit  34.83 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  34.98 
 
 		 280 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1150  tryptophan synthase subunit alpha  34.98 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  34.19 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  36.65 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  34.73 
 
 		 259 aa  152  7e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  37.78 
 
 		 271 aa  151  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4899  tryptophan synthase subunit alpha  34.5 
 
 		 253 aa  151  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08026  tryptophan synthase alpha chain  31.75 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1690  tryptophan synthase subunit alpha  36.02 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  34.6 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  31.97 
 
 		 723 aa  149  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  35.44 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  36.56 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  34.82 
 
 		 671 aa  149  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  33.04 
 
 		 279 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  33.63 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  37.78 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  35.12 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3297  tryptophan synthase subunit alpha  31.76 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.754487 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  35.46 
 
 		 264 aa  148  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  31.54 
 
 		 256 aa  148  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  38.91 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  33.9 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  37.72 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  36.84 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  37.28 
 
 		 269 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  34.63 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  36.87 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  35.32 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1172  tryptophan synthase, alpha chain  32.2 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  36.87 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  35.44 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  37.33 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2466  tryptophan synthase subunit alpha  34.29 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3306  tryptophan synthase, alpha subunit  30.8 
 
 		 252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.333024  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  31.85 
 
 		 268 aa  145  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  37.73 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  32.64 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  31.69 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  32.66 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  34.7 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  37.56 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  36.61 
 
 		 271 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1315  tryptophan synthase subunit alpha  34.71 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.52445  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1171  tryptophan synthase subunit alpha  35.56 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  36.6 
 
 		 270 aa  142  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>