More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41702 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  49.58 
 
 		 723 aa  681    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06290  tryptophan synthase, putative  51.44 
 
 		 715 aa  683    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.524376  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  100 
 
 		 671 aa  1380    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  52.71 
 
 		 700 aa  701    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  64.94 
 
 		 409 aa  536  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  62.34 
 
 		 418 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  62.15 
 
 		 401 aa  514  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1451  tryptophan synthase subunit beta  64.55 
 
 		 414 aa  509  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  61.83 
 
 		 401 aa  510  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.65 
 
 		 409 aa  511  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  62.03 
 
 		 406 aa  510  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  62.18 
 
 		 402 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  61.01 
 
 		 405 aa  504  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  59.7 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  60.81 
 
 		 394 aa  502  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  59.45 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 397 aa  505  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  63.38 
 
 		 402 aa  504  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  59.7 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  61 
 
 		 404 aa  503  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  59.45 
 
 		 411 aa  502  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  60.82 
 
 		 410 aa  504  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  59.7 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  59.15 
 
 		 403 aa  501  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2947  tryptophan synthase, beta subunit  59.12 
 
 		 455 aa  501  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.378076  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 412 aa  499  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  59.34 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 398 aa  501  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  59.75 
 
 		 397 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  61.68 
 
 		 414 aa  501  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  60.87 
 
 		 403 aa  501  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  60.35 
 
 		 400 aa  501  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 397 aa  502  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  60.82 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  59.75 
 
 		 397 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  60.82 
 
 		 399 aa  495  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  61.58 
 
 		 413 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  61.6 
 
 		 397 aa  498  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  59.75 
 
 		 397 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  58.61 
 
 		 399 aa  498  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  58.61 
 
 		 399 aa  498  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  59.7 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  59.19 
 
 		 397 aa  498  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  59.09 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01270  tryptophan synthase subunit beta  60.93 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  59.65 
 
 		 420 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1788  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 435 aa  497  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  59.34 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  59.75 
 
 		 397 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2090  tryptophan synthase subunit beta  66.05 
 
 		 403 aa  496  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.195131  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  60.21 
 
 		 428 aa  497  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3191  tryptophan synthase, beta subunit  60.15 
 
 		 405 aa  497  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 		 406 aa  496  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  61.34 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 410 aa  496  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  59.75 
 
 		 397 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  59.75 
 
 		 397 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  61.58 
 
 		 413 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2940  Tryptophan synthase  62.11 
 
 		 414 aa  495  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1415  tryptophan synthase subunit beta  59.55 
 
 		 425 aa  493  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 403 aa  495  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3585  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 409 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  61.73 
 
 		 406 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  58.75 
 
 		 406 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  58.69 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  61.08 
 
 		 399 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  63.13 
 
 		 399 aa  493  9.999999999999999e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3270  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 409 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.244666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  59.15 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  61.42 
 
 		 402 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  59.15 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  59.4 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 394 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  58.69 
 
 		 397 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 434 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0222  tryptophan synthase subunit beta  60.25 
 
 		 399 aa  491  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.580627  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  58.5 
 
 		 415 aa  491  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 		 406 aa  489  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  59.35 
 
 		 413 aa  492  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2688  tryptophan synthase subunit beta  58.84 
 
 		 408 aa  489  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  58.5 
 
 		 406 aa  492  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  60.97 
 
 		 401 aa  491  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  60.93 
 
 		 424 aa  489  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  57.87 
 
 		 407 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 420 aa  491  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  492  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 405 aa  491  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  59.08 
 
 		 391 aa  491  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  61.04 
 
 		 402 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>