More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1911 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 413 aa  852    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  81.58 
 
 		 420 aa  698    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  87.07 
 
 		 413 aa  749    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  90.07 
 
 		 413 aa  773    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  81.42 
 
 		 411 aa  697    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  86.59 
 
 		 413 aa  744    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  84.48 
 
 		 413 aa  707    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  85.93 
 
 		 415 aa  716    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  73.04 
 
 		 417 aa  634    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  85.85 
 
 		 409 aa  739    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2098  tryptophan synthase subunit beta  75.68 
 
 		 418 aa  623  1e-177  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27051  tryptophan synthase subunit beta  76.47 
 
 		 421 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  72.64 
 
 		 416 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  73.22 
 
 		 417 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  72.73 
 
 		 417 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2418  tryptophan synthase subunit beta  74.16 
 
 		 418 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01931  tryptophan synthase subunit beta  74.11 
 
 		 414 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  73.86 
 
 		 414 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0166  tryptophan synthase subunit beta  72.84 
 
 		 414 aa  604  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0594261  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01841  tryptophan synthase subunit beta  73.1 
 
 		 414 aa  604  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  68.21 
 
 		 409 aa  558  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  66.41 
 
 		 402 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  66.15 
 
 		 399 aa  539  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  65.31 
 
 		 391 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  63.48 
 
 		 418 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  66.15 
 
 		 399 aa  539  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  63.66 
 
 		 409 aa  539  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  66.15 
 
 		 406 aa  538  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  65.48 
 
 		 399 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  64.02 
 
 		 399 aa  535  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  65.48 
 
 		 399 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  62.9 
 
 		 410 aa  535  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  65.38 
 
 		 402 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  63.32 
 
 		 397 aa  531  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  66.25 
 
 		 402 aa  533  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  63.08 
 
 		 409 aa  531  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  65.38 
 
 		 410 aa  532  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  65.65 
 
 		 398 aa  531  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  63.32 
 
 		 397 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  64.23 
 
 		 405 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  62.81 
 
 		 397 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  62.81 
 
 		 397 aa  529  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 		 397 aa  528  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  61.98 
 
 		 411 aa  530  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  64.48 
 
 		 405 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4976  tryptophan synthase subunit beta  66.24 
 
 		 410 aa  528  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  62.81 
 
 		 397 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  62.81 
 
 		 397 aa  528  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  66.15 
 
 		 393 aa  530  1e-149  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 		 397 aa  528  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  64.97 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  64.47 
 
 		 401 aa  528  1e-149  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  63.68 
 
 		 404 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  64.47 
 
 		 397 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  64.23 
 
 		 405 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  62.07 
 
 		 411 aa  527  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0827  tryptophan synthase subunit beta  64.34 
 
 		 399 aa  525  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  66.16 
 
 		 395 aa  525  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  64.23 
 
 		 405 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  64.48 
 
 		 410 aa  525  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  62.06 
 
 		 397 aa  524  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  62.13 
 
 		 404 aa  523  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 397 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  62.94 
 
 		 397 aa  521  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  63.87 
 
 		 396 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  63.45 
 
 		 408 aa  521  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  62.94 
 
 		 397 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 397 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  64.21 
 
 		 396 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  63.71 
 
 		 405 aa  524  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 415 aa  521  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 397 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  63.04 
 
 		 403 aa  521  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 406 aa  518  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  62.94 
 
 		 414 aa  519  1e-146  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  62.31 
 
 		 394 aa  520  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  61.73 
 
 		 406 aa  519  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  61.73 
 
 		 406 aa  519  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  64.41 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  61.87 
 
 		 401 aa  518  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  61.62 
 
 		 403 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  64.44 
 
 		 406 aa  520  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  62.22 
 
 		 412 aa  520  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  62.94 
 
 		 397 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  62.78 
 
 		 397 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  61.04 
 
 		 406 aa  521  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  61.73 
 
 		 406 aa  520  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  60.54 
 
 		 406 aa  520  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3887  tryptophan synthase subunit beta  63.73 
 
 		 410 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.85731 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  61.68 
 
 		 406 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  64.47 
 
 		 396 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>