More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1864 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 
391 aa  803    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  71.03 
 
 
396 aa  589  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  70.51 
 
 
396 aa  590  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  69.74 
 
 
396 aa  585  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  71.21 
 
 
397 aa  587  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  68.12 
 
 
397 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  68.89 
 
 
396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  69.15 
 
 
394 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  70.68 
 
 
393 aa  572  1.0000000000000001e-162  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  68.12 
 
 
399 aa  567  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  68.12 
 
 
399 aa  567  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  67.87 
 
 
397 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  68.38 
 
 
397 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  68.64 
 
 
397 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  67.87 
 
 
397 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  67.1 
 
 
403 aa  558  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  67.61 
 
 
397 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  67.35 
 
 
397 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  68.93 
 
 
404 aa  558  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  67.61 
 
 
397 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  67.87 
 
 
397 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  67.45 
 
 
409 aa  558  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  67.61 
 
 
397 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  67.87 
 
 
397 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  65.3 
 
 
409 aa  554  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  67.35 
 
 
397 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  67.35 
 
 
397 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  67.35 
 
 
397 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  66.24 
 
 
394 aa  555  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  67.35 
 
 
397 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  67.35 
 
 
397 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  67.35 
 
 
397 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  67.27 
 
 
414 aa  556  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  67.35 
 
 
397 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  67.35 
 
 
397 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  67.35 
 
 
397 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  67.35 
 
 
397 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  67.98 
 
 
411 aa  555  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  67.35 
 
 
397 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  65.81 
 
 
396 aa  551  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  67.1 
 
 
407 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  66.75 
 
 
410 aa  548  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  68.83 
 
 
404 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  66.23 
 
 
401 aa  548  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  66.93 
 
 
402 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  66.92 
 
 
400 aa  548  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 
402 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  68.39 
 
 
405 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  66.32 
 
 
409 aa  545  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  66.16 
 
 
413 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  66.16 
 
 
413 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  64.42 
 
 
394 aa  541  1e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  66.14 
 
 
406 aa  544  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  66.75 
 
 
409 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2128  tryptophan synthase, beta subunit  66.15 
 
 
394 aa  543  1e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  66.23 
 
 
409 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  68.48 
 
 
395 aa  542  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  65.19 
 
 
397 aa  543  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  63.9 
 
 
394 aa  543  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  64.01 
 
 
404 aa  543  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  63.64 
 
 
394 aa  543  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  67.88 
 
 
402 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3843  tryptophan synthase subunit beta  65.55 
 
 
394 aa  543  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  65.19 
 
 
397 aa  542  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  64.27 
 
 
410 aa  543  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  64.01 
 
 
405 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1031  tryptophan synthase subunit beta  63.43 
 
 
410 aa  538  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.466116  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  63.24 
 
 
402 aa  538  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  65.31 
 
 
413 aa  540  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  64.68 
 
 
397 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  65.45 
 
 
405 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  65.3 
 
 
401 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  64.27 
 
 
408 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  64.95 
 
 
397 aa  539  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  66.58 
 
 
398 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  65.04 
 
 
399 aa  538  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  65.71 
 
 
394 aa  538  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  64.16 
 
 
397 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  65.46 
 
 
397 aa  541  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  63.64 
 
 
394 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  64.36 
 
 
412 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  64.16 
 
 
397 aa  535  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  63.9 
 
 
397 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  63.9 
 
 
397 aa  535  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  63.9 
 
 
397 aa  534  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  63.9 
 
 
397 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  64.36 
 
 
403 aa  537  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  65.3 
 
 
410 aa  537  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  66.49 
 
 
399 aa  535  1e-151  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  64.66 
 
 
405 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  63.5 
 
 
399 aa  531  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  61.89 
 
 
411 aa  533  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1119  tryptophan synthase subunit beta  65.3 
 
 
399 aa  531  1e-150  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00584813  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  63.24 
 
 
406 aa  531  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  64.66 
 
 
405 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1691  tryptophan synthase subunit beta  65.98 
 
 
393 aa  532  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1771  tryptophan synthase subunit beta  66.84 
 
 
410 aa  532  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  64.52 
 
 
418 aa  534  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  63.52 
 
 
410 aa  531  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0839  tryptophan synthase, beta subunit  65.46 
 
 
401 aa  532  1e-150  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>