More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4724 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  80.05 
 
 		 413 aa  674    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  81.89 
 
 		 415 aa  696    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 411 aa  847    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  83.76 
 
 		 413 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  81.42 
 
 		 413 aa  697    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  80 
 
 		 413 aa  681    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  76.94 
 
 		 420 aa  660    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  83.5 
 
 		 413 aa  693    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  81.27 
 
 		 409 aa  691    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  70.15 
 
 		 416 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  71.97 
 
 		 417 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  72.08 
 
 		 417 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  72.08 
 
 		 417 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2098  tryptophan synthase subunit beta  71.57 
 
 		 418 aa  595  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  70.56 
 
 		 414 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01841  tryptophan synthase subunit beta  70.3 
 
 		 414 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01931  tryptophan synthase subunit beta  70.3 
 
 		 414 aa  594  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27051  tryptophan synthase subunit beta  72.68 
 
 		 421 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2418  tryptophan synthase subunit beta  73.23 
 
 		 418 aa  589  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0166  tryptophan synthase subunit beta  69.8 
 
 		 414 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0594261  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  65.3 
 
 		 409 aa  536  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  63.5 
 
 		 391 aa  531  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  63.32 
 
 		 402 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  63.38 
 
 		 406 aa  524  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  64.75 
 
 		 395 aa  521  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  62.13 
 
 		 411 aa  521  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  65.19 
 
 		 393 aa  524  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 		 402 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  63.82 
 
 		 405 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  63.82 
 
 		 405 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  61.67 
 
 		 408 aa  518  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  61.52 
 
 		 404 aa  519  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  64.12 
 
 		 409 aa  521  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  63.82 
 
 		 405 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  63.82 
 
 		 405 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  65.74 
 
 		 402 aa  520  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 409 aa  519  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  61.21 
 
 		 397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  63.61 
 
 		 396 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  62.76 
 
 		 399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  62.76 
 
 		 399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0143  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 405 aa  514  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4976  tryptophan synthase subunit beta  63 
 
 		 410 aa  514  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  61.71 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  61.71 
 
 		 397 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  61.21 
 
 		 397 aa  514  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  61.21 
 
 		 397 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  61.21 
 
 		 397 aa  513  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  60.96 
 
 		 397 aa  513  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 410 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3585  tryptophan synthase subunit beta  63.29 
 
 		 409 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 		 396 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.21 
 
 		 397 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3270  tryptophan synthase subunit beta  63.29 
 
 		 409 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.244666 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 		 418 aa  512  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  61 
 
 		 410 aa  513  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3887  tryptophan synthase subunit beta  63.89 
 
 		 410 aa  511  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.85731 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1943  tryptophan synthase subunit beta  63.64 
 
 		 399 aa  514  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.233821  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  62.24 
 
 		 403 aa  508  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  62.5 
 
 		 398 aa  510  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  62.95 
 
 		 404 aa  510  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  59.66 
 
 		 411 aa  510  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  61.88 
 
 		 406 aa  509  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  61.7 
 
 		 399 aa  510  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  63.38 
 
 		 410 aa  511  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  61.11 
 
 		 396 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 403 aa  508  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  60.97 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  60.85 
 
 		 404 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  61.32 
 
 		 402 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 397 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 397 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0827  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 399 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 397 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  61.83 
 
 		 409 aa  501  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  59.75 
 
 		 404 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  62.34 
 
 		 409 aa  501  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 406 aa  501  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 		 394 aa  501  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  62.53 
 
 		 401 aa  501  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 404 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 404 aa  504  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  59.47 
 
 		 409 aa  504  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0206  tryptophan synthase subunit beta  60.86 
 
 		 419 aa  503  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  62.92 
 
 		 394 aa  501  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  60.35 
 
 		 401 aa  503  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1031  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 410 aa  503  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.466116  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  59.44 
 
 		 397 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>