More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3321 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  97.98 
 
 		 396 aa  802    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  81.31 
 
 		 396 aa  686    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 396 aa  814    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  74.75 
 
 		 396 aa  638    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  77.53 
 
 		 397 aa  661    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  84.34 
 
 		 397 aa  711    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  72.01 
 
 		 402 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  70.51 
 
 		 391 aa  590  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  69.72 
 
 		 399 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  69.72 
 
 		 399 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  69.97 
 
 		 409 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  70.48 
 
 		 405 aa  567  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  68.62 
 
 		 408 aa  567  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  69.11 
 
 		 410 aa  567  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  68.19 
 
 		 399 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  68.19 
 
 		 399 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  69.47 
 
 		 409 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  67.94 
 
 		 411 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  67.85 
 
 		 404 aa  560  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  67.6 
 
 		 405 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  67.6 
 
 		 405 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  68.03 
 
 		 409 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  67.6 
 
 		 405 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  67.18 
 
 		 394 aa  557  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  68.64 
 
 		 402 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  68.19 
 
 		 406 aa  555  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  65.9 
 
 		 410 aa  554  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  68.12 
 
 		 402 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  67.43 
 
 		 406 aa  556  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  67.09 
 
 		 403 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 424 aa  553  1e-156  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  68.64 
 
 		 410 aa  552  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  66.84 
 
 		 404 aa  551  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  67.59 
 
 		 403 aa  554  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  67.09 
 
 		 397 aa  551  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 424 aa  552  1e-156  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  67.6 
 
 		 405 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  67.18 
 
 		 405 aa  550  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  66.5 
 
 		 409 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  66.33 
 
 		 397 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  64.3 
 
 		 406 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  64.63 
 
 		 411 aa  551  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  65.57 
 
 		 397 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 401 aa  548  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  66.58 
 
 		 397 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  66.84 
 
 		 397 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  67.43 
 
 		 415 aa  549  1e-155  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  65.14 
 
 		 406 aa  545  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  65.74 
 
 		 409 aa  546  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  63.8 
 
 		 406 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  66.16 
 
 		 403 aa  544  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  65.14 
 
 		 396 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  65.57 
 
 		 397 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  66.58 
 
 		 397 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 410 aa  544  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  64.89 
 
 		 406 aa  546  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  64.63 
 
 		 406 aa  544  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  64.52 
 
 		 397 aa  542  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  65.39 
 
 		 397 aa  541  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  65.06 
 
 		 397 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  64.81 
 
 		 397 aa  544  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 402 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  65.06 
 
 		 397 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  65.65 
 
 		 403 aa  543  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1031  tryptophan synthase subunit beta  65.74 
 
 		 410 aa  544  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.466116  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  65.32 
 
 		 397 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  543  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  65.32 
 
 		 397 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  65.48 
 
 		 400 aa  544  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  65.39 
 
 		 407 aa  542  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  64.81 
 
 		 397 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  64.81 
 
 		 397 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  64.81 
 
 		 397 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  65.31 
 
 		 397 aa  542  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  64.38 
 
 		 422 aa  542  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  65.39 
 
 		 412 aa  541  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  544  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  65.06 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  65.06 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  64.52 
 
 		 397 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  64.52 
 
 		 397 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  64.52 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  65.06 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  65.06 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  64.52 
 
 		 397 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  63.8 
 
 		 406 aa  540  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  65.05 
 
 		 401 aa  538  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  65.06 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  66.32 
 
 		 404 aa  540  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  66.93 
 
 		 406 aa  540  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  64.52 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1771  tryptophan synthase subunit beta  68.38 
 
 		 410 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  63.75 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  65.39 
 
 		 418 aa  534  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0063  tryptophan synthase subunit beta  64.84 
 
 		 414 aa  537  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  65.55 
 
 		 411 aa  535  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  65.71 
 
 		 409 aa  537  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  64.03 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  63.17 
 
 		 394 aa  536  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  64.96 
 
 		 404 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>