More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1531 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 417 aa  862    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2098  tryptophan synthase subunit beta  81.86 
 
 		 418 aa  716    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2418  tryptophan synthase subunit beta  82.34 
 
 		 418 aa  698    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0166  tryptophan synthase subunit beta  77 
 
 		 414 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0594261  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  99.52 
 
 		 417 aa  860    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01931  tryptophan synthase subunit beta  79.18 
 
 		 414 aa  689    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  79.31 
 
 		 414 aa  676    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01841  tryptophan synthase subunit beta  79.06 
 
 		 414 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27051  tryptophan synthase subunit beta  82.25 
 
 		 421 aa  706    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  82.97 
 
 		 416 aa  727    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  75.19 
 
 		 413 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  75.19 
 
 		 420 aa  622  1e-177  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  73.92 
 
 		 409 aa  617  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  73.55 
 
 		 413 aa  614  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  73.55 
 
 		 413 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  72.73 
 
 		 413 aa  614  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  73.6 
 
 		 413 aa  613  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  73.55 
 
 		 415 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  69.83 
 
 		 417 aa  597  1e-169  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  72.08 
 
 		 411 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  65.38 
 
 		 409 aa  544  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  64.47 
 
 		 399 aa  535  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  64.47 
 
 		 399 aa  535  1e-151  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  63.32 
 
 		 397 aa  537  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  66.24 
 
 		 393 aa  530  1e-149  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  63.08 
 
 		 397 aa  528  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  63.08 
 
 		 397 aa  528  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  63.08 
 
 		 397 aa  529  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  62.82 
 
 		 397 aa  529  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  63.08 
 
 		 397 aa  528  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  63.08 
 
 		 397 aa  528  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  65.49 
 
 		 401 aa  530  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  63.45 
 
 		 391 aa  530  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  63.08 
 
 		 397 aa  528  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  62.82 
 
 		 397 aa  527  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  63.68 
 
 		 399 aa  527  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  63.68 
 
 		 399 aa  527  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  63.59 
 
 		 404 aa  525  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  63.68 
 
 		 399 aa  526  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 		 397 aa  524  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  62.09 
 
 		 396 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  60.43 
 
 		 407 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  62.34 
 
 		 396 aa  521  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  63.3 
 
 		 409 aa  522  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 409 aa  518  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  63.61 
 
 		 402 aa  519  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  62.03 
 
 		 411 aa  519  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  61.35 
 
 		 396 aa  519  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 403 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  61.77 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  61.77 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  61.77 
 
 		 397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  61.81 
 
 		 397 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  62.28 
 
 		 397 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  61.31 
 
 		 396 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  61.77 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  62.03 
 
 		 397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  61.31 
 
 		 397 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  61.77 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  61.77 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  62.53 
 
 		 397 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  61.77 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  60.55 
 
 		 405 aa  514  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  61.77 
 
 		 397 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  61.31 
 
 		 397 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  60.55 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  61.06 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 		 403 aa  511  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  59.3 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0870  tryptophan synthase subunit beta  60.85 
 
 		 399 aa  508  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318108 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  61.06 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0143  tryptophan synthase subunit beta  62.78 
 
 		 405 aa  511  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 408 aa  509  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  58.99 
 
 		 404 aa  510  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  60.29 
 
 		 418 aa  511  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  63.57 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 410 aa  510  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  58.75 
 
 		 404 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  60.75 
 
 		 405 aa  505  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  61.27 
 
 		 399 aa  507  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  63.8 
 
 		 395 aa  506  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  58.99 
 
 		 404 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  60.3 
 
 		 403 aa  505  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  61.01 
 
 		 402 aa  504  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 402 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  60.45 
 
 		 402 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  60.9 
 
 		 414 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4976  tryptophan synthase subunit beta  61.81 
 
 		 410 aa  505  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  61.17 
 
 		 410 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  60.5 
 
 		 406 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  61.14 
 
 		 409 aa  503  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  61.11 
 
 		 400 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0201  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  59.4 
 
 		 412 aa  504  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  61.33 
 
 		 410 aa  501  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  59 
 
 		 434 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>