More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1668 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 404 aa  827    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  68.93 
 
 		 391 aa  558  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  66.07 
 
 		 397 aa  549  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  66.92 
 
 		 397 aa  548  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  65.55 
 
 		 397 aa  546  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  65.81 
 
 		 397 aa  547  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  65.3 
 
 		 397 aa  546  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  65.24 
 
 		 401 aa  547  1e-154  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  65.04 
 
 		 397 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  65.04 
 
 		 397 aa  543  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  65.04 
 
 		 397 aa  543  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  65.04 
 
 		 397 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  65.04 
 
 		 397 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  66.49 
 
 		 404 aa  541  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  66.32 
 
 		 396 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  69.23 
 
 		 393 aa  538  9.999999999999999e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  66.06 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  65.54 
 
 		 396 aa  535  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  65.21 
 
 		 414 aa  537  1e-151  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  66.16 
 
 		 399 aa  534  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  65.32 
 
 		 405 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  66.16 
 
 		 399 aa  534  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  65.28 
 
 		 396 aa  528  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  64.51 
 
 		 394 aa  529  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  63.78 
 
 		 397 aa  530  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  63.59 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  64.71 
 
 		 402 aa  525  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  64.99 
 
 		 401 aa  527  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  63.59 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2098  tryptophan synthase subunit beta  64.9 
 
 		 418 aa  521  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  64.1 
 
 		 403 aa  523  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  66.41 
 
 		 409 aa  521  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 		 402 aa  521  1e-147  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  62.82 
 
 		 406 aa  522  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 405 aa  519  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  65.37 
 
 		 402 aa  519  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  63 
 
 		 416 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  63.08 
 
 		 399 aa  518  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  63.08 
 
 		 399 aa  518  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  65.01 
 
 		 409 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  63.52 
 
 		 399 aa  514  1.0000000000000001e-145  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0097  tryptophan synthase subunit beta  65.45 
 
 		 407 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 397 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  63.38 
 
 		 401 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  63.36 
 
 		 397 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  63.33 
 
 		 403 aa  514  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 394 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  66.58 
 
 		 410 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  65.65 
 
 		 406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 397 aa  514  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  63.9 
 
 		 409 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  62.94 
 
 		 409 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  64.81 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  64.36 
 
 		 394 aa  513  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  63.36 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  64.77 
 
 		 405 aa  511  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  64.51 
 
 		 404 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  62.27 
 
 		 405 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  62.88 
 
 		 407 aa  511  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  63.57 
 
 		 410 aa  514  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  63.94 
 
 		 409 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 397 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 		 414 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  62.27 
 
 		 405 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0118  tryptophan synthase subunit beta  62.31 
 
 		 413 aa  508  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  62.85 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  62.85 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3843  tryptophan synthase subunit beta  62.37 
 
 		 394 aa  509  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  62.85 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  62.85 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  64.65 
 
 		 413 aa  509  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  62.85 
 
 		 397 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  63.38 
 
 		 410 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  62.27 
 
 		 405 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  63.47 
 
 		 406 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01931  tryptophan synthase subunit beta  62.15 
 
 		 414 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0176  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 		 430 aa  510  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  63.87 
 
 		 420 aa  509  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4976  tryptophan synthase subunit beta  65.22 
 
 		 410 aa  510  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2128  tryptophan synthase, beta subunit  60.62 
 
 		 394 aa  508  1e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  63.87 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  62.85 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  64.25 
 
 		 406 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0063  tryptophan synthase subunit beta  63.29 
 
 		 414 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01841  tryptophan synthase subunit beta  61.89 
 
 		 414 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  62.92 
 
 		 411 aa  510  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  62.6 
 
 		 402 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  63.17 
 
 		 418 aa  508  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  62.85 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  62.85 
 
 		 397 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  62.88 
 
 		 403 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  62.27 
 
 		 405 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  62.86 
 
 		 406 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  62.76 
 
 		 404 aa  505  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0143  tryptophan synthase subunit beta  63.33 
 
 		 405 aa  505  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>