More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0113 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 399 aa  817    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  69.44 
 
 		 414 aa  578  1e-164  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  68.64 
 
 		 409 aa  551  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  66.49 
 
 		 391 aa  535  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  64.19 
 
 		 396 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  62.76 
 
 		 399 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  62.76 
 
 		 399 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  64.21 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  64.21 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  64.21 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  63.52 
 
 		 404 aa  514  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  62.92 
 
 		 396 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  64.21 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  63.89 
 
 		 401 aa  515  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  65.38 
 
 		 393 aa  514  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 		 401 aa  517  1.0000000000000001e-145  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  63.71 
 
 		 397 aa  512  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  64.21 
 
 		 397 aa  514  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  63.96 
 
 		 397 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  63.2 
 
 		 397 aa  511  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  63.45 
 
 		 397 aa  511  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 395 aa  508  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  65.46 
 
 		 389 aa  510  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  65.46 
 
 		 389 aa  510  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  61.97 
 
 		 404 aa  508  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  61.7 
 
 		 402 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  64.34 
 
 		 398 aa  510  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  62.03 
 
 		 396 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  61.18 
 
 		 394 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  62.66 
 
 		 399 aa  507  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  61.95 
 
 		 397 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 		 399 aa  504  1e-141  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  60.76 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 		 399 aa  504  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  61.44 
 
 		 406 aa  502  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  60.91 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  63.59 
 
 		 402 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  60.77 
 
 		 415 aa  498  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  62.6 
 
 		 401 aa  499  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  61.01 
 
 		 396 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  60.45 
 
 		 400 aa  498  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0063  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 414 aa  498  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  60.81 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  62.09 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 397 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  60.81 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  61.32 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3016  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 445 aa  496  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0445574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1158  tryptophan synthase subunit beta  63.59 
 
 		 408 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  59.19 
 
 		 410 aa  497  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 394 aa  495  1e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  64.8 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  60.91 
 
 		 413 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  61.58 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  61.07 
 
 		 402 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 424 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 413 aa  492  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  61.7 
 
 		 394 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  60.81 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 418 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  60.76 
 
 		 394 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1691  tryptophan synthase subunit beta  63.09 
 
 		 393 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 403 aa  492  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  60.56 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  60.81 
 
 		 397 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  61.83 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  60.81 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  60.91 
 
 		 415 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  60.81 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  63.13 
 
 		 671 aa  493  9.999999999999999e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0097  tryptophan synthase subunit beta  58.08 
 
 		 407 aa  488  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2688  tryptophan synthase subunit beta  59.34 
 
 		 408 aa  491  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 408 aa  488  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3191  tryptophan synthase, beta subunit  60.67 
 
 		 405 aa  491  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  57.43 
 
 		 404 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  61.58 
 
 		 397 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  60.76 
 
 		 412 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 		 399 aa  491  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2859  tryptophan synthase, beta subunit  62.2 
 
 		 391 aa  488  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1321  tryptophan synthase subunit beta  65.22 
 
 		 373 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000135158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  58.78 
 
 		 406 aa  491  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 409 aa  488  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4173  tryptophan synthase subunit beta  59.14 
 
 		 432 aa  484  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1361  tryptophan synthase subunit beta  64.3 
 
 		 391 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.059714  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0055  tryptophan synthase subunit beta  58.78 
 
 		 414 aa  488  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.660106  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0695  tryptophan synthase subunit beta  64.19 
 
 		 401 aa  487  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  59.19 
 
 		 404 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>