More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0328 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  94.92 
 
 		 394 aa  774    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  95.43 
 
 		 394 aa  779    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  94.92 
 
 		 394 aa  773    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 394 aa  810    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  68.23 
 
 		 389 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  64.42 
 
 		 391 aa  541  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  63.99 
 
 		 397 aa  531  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  63.73 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  63.21 
 
 		 414 aa  526  1e-148  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  65.45 
 
 		 394 aa  522  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  64.4 
 
 		 404 aa  519  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  63.21 
 
 		 397 aa  519  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  62.89 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  63.21 
 
 		 394 aa  511  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  62.34 
 
 		 396 aa  508  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  62.89 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  62.89 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  61.82 
 
 		 396 aa  511  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 		 396 aa  508  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  62.11 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  61.15 
 
 		 405 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  62.11 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  63.12 
 
 		 393 aa  507  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.15 
 
 		 409 aa  504  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2805  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 396 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1660  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 396 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  62.11 
 
 		 402 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2726  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 396 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.93556  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  61.34 
 
 		 402 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  62.37 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2407  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 396 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1586  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 409 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  61.86 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  61.86 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  62.6 
 
 		 402 aa  501  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2705  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 398 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1682  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 407 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.86 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1433  tryptophan synthase subunit beta  60.77 
 
 		 404 aa  502  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  60.47 
 
 		 401 aa  504  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0076  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 390 aa  502  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1462  tryptophan synthase subunit beta  60.77 
 
 		 404 aa  502  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3023  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 396 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  60.73 
 
 		 397 aa  501  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 405 aa  498  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02292  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 393 aa  498  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2128  tryptophan synthase, beta subunit  61.58 
 
 		 394 aa  499  1e-140  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  61.5 
 
 		 404 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2454  tryptophan synthase subunit beta  58.67 
 
 		 401 aa  501  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  60.73 
 
 		 411 aa  499  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  59.23 
 
 		 409 aa  500  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2916  tryptophan synthase subunit beta  59.34 
 
 		 407 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.511307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1458  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 396 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1524  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 396 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0500753 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1425  tryptophan synthase subunit beta  58.93 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2255  tryptophan synthase subunit beta  59.34 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0836198 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  61.52 
 
 		 406 aa  500  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1516  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 396 aa  500  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  61.24 
 
 		 411 aa  498  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  62.04 
 
 		 409 aa  495  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1691  tryptophan synthase subunit beta  62.02 
 
 		 393 aa  497  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  59.69 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  61.14 
 
 		 410 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  60.47 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  60.21 
 
 		 395 aa  495  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  60.42 
 
 		 412 aa  497  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003084  tryptophan synthase beta chain  57.87 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  60.99 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0792  tryptophan synthase subunit beta  58.27 
 
 		 396 aa  494  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00347207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  61.18 
 
 		 406 aa  498  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1415  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 425 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 397 aa  495  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 406 aa  497  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1150  tryptophan synthase subunit beta  58.78 
 
 		 396 aa  498  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  60.47 
 
 		 397 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  60.89 
 
 		 404 aa  495  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 403 aa  496  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  60.63 
 
 		 397 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2133  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.31152  normal  0.733883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0097  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 407 aa  494  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  60.47 
 
 		 422 aa  491  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1936  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 396 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  60.47 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3622  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 426 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  60.52 
 
 		 405 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  60.21 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  59.43 
 
 		 399 aa  491  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  60.21 
 
 		 397 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  60.21 
 
 		 397 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 400 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  61.52 
 
 		 404 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  60.21 
 
 		 397 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0223  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 388 aa  491  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  61.26 
 
 		 401 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1394  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 392 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000239329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02762  tryptophan synthase subunit beta  57.76 
 
 		 396 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  60.76 
 
 		 399 aa  494  9.999999999999999e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>