More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3218 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 394 aa  815    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3843  tryptophan synthase subunit beta  77.81 
 
 		 394 aa  635    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  81.98 
 
 		 394 aa  677    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2128  tryptophan synthase, beta subunit  73.78 
 
 		 394 aa  609  1e-173  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1176  tryptophan synthase subunit beta  69.13 
 
 		 395 aa  564  1e-160  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.833361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  66.24 
 
 		 391 aa  555  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  63.59 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  62.05 
 
 		 396 aa  531  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  63.5 
 
 		 396 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  61.18 
 
 		 396 aa  521  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  64.25 
 
 		 401 aa  523  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  64.25 
 
 		 397 aa  520  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  61.44 
 
 		 396 aa  518  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  63.73 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  62.57 
 
 		 409 aa  518  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  63.73 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  63.73 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  63.21 
 
 		 397 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  63.73 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  65.03 
 
 		 393 aa  516  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  63.47 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 404 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 414 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  63.73 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  63.21 
 
 		 397 aa  513  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  62.95 
 
 		 394 aa  513  1e-144  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 394 aa  513  1e-144  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  63.21 
 
 		 394 aa  511  1e-144  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 409 aa  510  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 394 aa  509  1e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 413 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 		 401 aa  504  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 413 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  61.28 
 
 		 415 aa  501  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  59.18 
 
 		 413 aa  500  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 408 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 409 aa  498  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  60.77 
 
 		 410 aa  498  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  62.27 
 
 		 402 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  59.9 
 
 		 399 aa  500  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  62.66 
 
 		 402 aa  500  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 399 aa  495  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 399 aa  495  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  58.97 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 389 aa  495  1e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  56.67 
 
 		 402 aa  494  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1321  tryptophan synthase subunit beta  63.78 
 
 		 373 aa  495  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000135158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  61.4 
 
 		 406 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  58.31 
 
 		 403 aa  492  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  58.21 
 
 		 406 aa  491  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2874  tryptophan synthase, beta subunit  61.54 
 
 		 424 aa  491  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000102135  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 399 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 399 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  57.95 
 
 		 413 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 405 aa  488  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  58.21 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  57.95 
 
 		 394 aa  489  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 396 aa  488  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  58.14 
 
 		 399 aa  491  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  58.67 
 
 		 409 aa  488  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5701  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 411 aa  490  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.194969  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1216  tryptophan synthase subunit beta  59.17 
 
 		 414 aa  488  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.268288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0223  tryptophan synthase subunit beta  61.26 
 
 		 388 aa  489  1e-137  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3887  tryptophan synthase subunit beta  59.8 
 
 		 410 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.85731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  56.3 
 
 		 411 aa  491  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  61.6 
 
 		 420 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 406 aa  489  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 398 aa  489  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  61.13 
 
 		 420 aa  488  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  57.69 
 
 		 406 aa  488  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  57.95 
 
 		 397 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  59.59 
 
 		 409 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2054  tryptophan synthase, beta subunit  60.61 
 
 		 443 aa  488  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  63.2 
 
 		 399 aa  485  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3585  tryptophan synthase subunit beta  59.18 
 
 		 409 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  57.69 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 401 aa  487  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  57.8 
 
 		 405 aa  487  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  57.84 
 
 		 399 aa  488  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  57.84 
 
 		 399 aa  488  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  57.69 
 
 		 397 aa  484  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12890  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 418 aa  485  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal  0.0360199 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  57.95 
 
 		 397 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1349  tryptophan synthase, beta subunit  60.47 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106047 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  57.44 
 
 		 422 aa  486  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 406 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  58.16 
 
 		 413 aa  486  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3270  tryptophan synthase subunit beta  59.18 
 
 		 409 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.244666 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 411 aa  487  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  57.95 
 
 		 397 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1031  tryptophan synthase subunit beta  58.82 
 
 		 410 aa  488  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.466116  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  59.03 
 
 		 410 aa  484  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 411 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 406 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 402 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>