More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0480 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 405 aa  832    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  87.18 
 
 		 404 aa  716    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  68.39 
 
 		 391 aa  550  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  64.52 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  65.04 
 
 		 397 aa  537  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  534  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  533  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  65.32 
 
 		 404 aa  532  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  63.45 
 
 		 396 aa  518  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  63.99 
 
 		 409 aa  518  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  61.31 
 
 		 401 aa  520  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  63.68 
 
 		 397 aa  520  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  63.73 
 
 		 394 aa  514  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 396 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 396 aa  514  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  62.6 
 
 		 404 aa  514  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  62.11 
 
 		 399 aa  511  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  62.11 
 
 		 399 aa  511  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  64.36 
 
 		 402 aa  509  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  62.94 
 
 		 414 aa  509  1e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  62.82 
 
 		 396 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1321  tryptophan synthase subunit beta  65.14 
 
 		 373 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000135158 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  62.95 
 
 		 399 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 396 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  62.95 
 
 		 399 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  62.79 
 
 		 409 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0942  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 402 aa  503  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0673  tryptophan synthase subunit beta  63.08 
 
 		 400 aa  503  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 405 aa  502  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  62.53 
 
 		 402 aa  502  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  63.01 
 
 		 410 aa  503  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  62.31 
 
 		 406 aa  501  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0776  tryptophan synthase subunit beta  62.82 
 
 		 400 aa  502  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  61.18 
 
 		 406 aa  501  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  61.52 
 
 		 405 aa  500  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  61.18 
 
 		 410 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  63.8 
 
 		 401 aa  498  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  60.66 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  60.91 
 
 		 404 aa  498  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  61.08 
 
 		 403 aa  500  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  61.28 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01270  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 405 aa  501  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  61.44 
 
 		 411 aa  499  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  61.95 
 
 		 411 aa  498  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  60.45 
 
 		 449 aa  498  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  61.13 
 
 		 409 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  61.6 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  60.81 
 
 		 409 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  61.35 
 
 		 417 aa  494  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  61.18 
 
 		 402 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  61.66 
 
 		 399 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  59.29 
 
 		 405 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  61.79 
 
 		 406 aa  491  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 397 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1462  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 404 aa  491  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1297  tryptophan synthase subunit beta  62.92 
 
 		 399 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.311384  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 397 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  61.54 
 
 		 409 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 398 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  59.29 
 
 		 405 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 397 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  61.24 
 
 		 400 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1433  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 404 aa  491  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 397 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  61.96 
 
 		 406 aa  491  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 397 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 410 aa  491  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3191  tryptophan synthase, beta subunit  59.39 
 
 		 405 aa  494  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  62.99 
 
 		 393 aa  492  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 411 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 406 aa  488  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 413 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  59.29 
 
 		 405 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 409 aa  491  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0215  tryptophan synthase subunit beta  61.84 
 
 		 391 aa  488  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 402 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 		 402 aa  490  1e-137  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1771  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 		 410 aa  488  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3701  tryptophan synthase subunit beta  61.17 
 
 		 396 aa  488  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>