More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1462 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0942  tryptophan synthase subunit beta  82.04 
 
 		 402 aa  691    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1462  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 404 aa  826    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1433  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 404 aa  826    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  67.18 
 
 		 397 aa  551  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  66.92 
 
 		 397 aa  548  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  67.18 
 
 		 397 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 397 aa  545  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 397 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 397 aa  546  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 397 aa  546  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 397 aa  546  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 397 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1321  tryptophan synthase subunit beta  66.4 
 
 		 373 aa  521  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000135158 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  61.6 
 
 		 397 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  62.08 
 
 		 391 aa  511  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  61.44 
 
 		 402 aa  509  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  62.76 
 
 		 409 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  61.03 
 
 		 394 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  60.77 
 
 		 394 aa  502  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  60.56 
 
 		 410 aa  504  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 394 aa  500  1e-140  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  58.31 
 
 		 404 aa  501  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  59.19 
 
 		 411 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 409 aa  499  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 402 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  61.04 
 
 		 401 aa  501  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  63.02 
 
 		 394 aa  499  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  58.87 
 
 		 409 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  61.2 
 
 		 418 aa  496  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 410 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  60.47 
 
 		 401 aa  497  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  58.48 
 
 		 406 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 402 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  58.61 
 
 		 409 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 405 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 395 aa  492  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  56.96 
 
 		 405 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  60.94 
 
 		 401 aa  489  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  60.84 
 
 		 404 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  57.72 
 
 		 411 aa  488  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  56.96 
 
 		 405 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 		 402 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  57.72 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 396 aa  487  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  57.43 
 
 		 404 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3843  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 		 394 aa  487  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  56.46 
 
 		 405 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  57.4 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  56.96 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 409 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  58.06 
 
 		 414 aa  482  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 394 aa  483  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  56.93 
 
 		 404 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 396 aa  482  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  57.35 
 
 		 417 aa  481  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  59.13 
 
 		 402 aa  483  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  55.92 
 
 		 406 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01931  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 399 aa  480  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 399 aa  480  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  56.17 
 
 		 406 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  58.55 
 
 		 403 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  60.42 
 
 		 393 aa  480  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  56.42 
 
 		 404 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  58.07 
 
 		 403 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  56.42 
 
 		 404 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  59.14 
 
 		 406 aa  479  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  58.91 
 
 		 398 aa  478  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 396 aa  480  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 411 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  57.21 
 
 		 406 aa  480  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  57.91 
 
 		 396 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  56.47 
 
 		 406 aa  474  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  58.75 
 
 		 389 aa  477  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0166  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 414 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0594261  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  56.93 
 
 		 408 aa  476  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 394 aa  478  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1771  tryptophan synthase subunit beta  60.93 
 
 		 410 aa  477  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 414 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  56.89 
 
 		 422 aa  471  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 403 aa  472  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  57.79 
 
 		 413 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  57.32 
 
 		 417 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  58.07 
 
 		 397 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  57.76 
 
 		 413 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  58.29 
 
 		 413 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  56.96 
 
 		 404 aa  474  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  57.32 
 
 		 417 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  59.48 
 
 		 394 aa  473  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  56.7 
 
 		 410 aa  472  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0097  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 407 aa  472  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01841  tryptophan synthase subunit beta  58.96 
 
 		 414 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  56.99 
 
 		 406 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>