More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0942 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0942  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 402 aa  824    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1462  tryptophan synthase subunit beta  82.04 
 
 		 404 aa  691    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1433  tryptophan synthase subunit beta  82.04 
 
 		 404 aa  691    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  67.61 
 
 		 397 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  67.61 
 
 		 397 aa  557  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  67.35 
 
 		 397 aa  555  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  67.61 
 
 		 397 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  67.61 
 
 		 397 aa  556  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  67.35 
 
 		 397 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  67.61 
 
 		 397 aa  557  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  67.61 
 
 		 397 aa  557  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  66.84 
 
 		 397 aa  551  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1321  tryptophan synthase subunit beta  67.39 
 
 		 373 aa  532  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000135158 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 404 aa  518  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  63.45 
 
 		 391 aa  513  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  63.21 
 
 		 401 aa  514  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  61.72 
 
 		 396 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  60.91 
 
 		 402 aa  504  9.999999999999999e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  60.88 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  62.5 
 
 		 396 aa  502  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 405 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  62.2 
 
 		 394 aa  504  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  61.4 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  61.2 
 
 		 409 aa  499  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  61.94 
 
 		 394 aa  500  1e-140  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  58.88 
 
 		 410 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 401 aa  498  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  58.5 
 
 		 411 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  60.67 
 
 		 410 aa  498  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  61.15 
 
 		 394 aa  495  1e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  58.4 
 
 		 411 aa  497  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  58.65 
 
 		 406 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 406 aa  496  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 406 aa  491  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  59.17 
 
 		 409 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  59.17 
 
 		 409 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  59.02 
 
 		 402 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 402 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 402 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  59.84 
 
 		 396 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  59.84 
 
 		 396 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 404 aa  494  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 422 aa  490  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  58.14 
 
 		 405 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  58.14 
 
 		 405 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 403 aa  490  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  60.16 
 
 		 409 aa  490  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  58.82 
 
 		 395 aa  490  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  57.95 
 
 		 405 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 405 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  57.54 
 
 		 406 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  62.01 
 
 		 393 aa  488  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  58.29 
 
 		 411 aa  488  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  58.14 
 
 		 405 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  59.84 
 
 		 409 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 		 394 aa  489  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  60.42 
 
 		 406 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  59.34 
 
 		 398 aa  487  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  58.29 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 		 389 aa  487  1e-136  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  58.73 
 
 		 406 aa  487  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 406 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  59.84 
 
 		 396 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 405 aa  481  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  58.96 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  60.16 
 
 		 406 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  60.37 
 
 		 394 aa  484  1e-135  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  59.33 
 
 		 401 aa  482  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  58.07 
 
 		 399 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  58.55 
 
 		 408 aa  481  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  58.03 
 
 		 410 aa  484  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  58.07 
 
 		 399 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  60.62 
 
 		 402 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01931  tryptophan synthase subunit beta  59.22 
 
 		 414 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  57.87 
 
 		 417 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0147  tryptophan synthase subunit beta  57.86 
 
 		 417 aa  478  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  57.77 
 
 		 394 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 406 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  57.62 
 
 		 404 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  58.22 
 
 		 403 aa  480  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 394 aa  479  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  57.87 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  57.62 
 
 		 404 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  57.14 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  58.16 
 
 		 406 aa  478  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0097  tryptophan synthase subunit beta  58.07 
 
 		 407 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  58.03 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  56.63 
 
 		 413 aa  474  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 404 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  57.36 
 
 		 404 aa  478  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  57.25 
 
 		 406 aa  475  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  57.25 
 
 		 413 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1394  tryptophan synthase subunit beta  58.02 
 
 		 392 aa  477  1e-133  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000239329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  57.25 
 
 		 413 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  57.25 
 
 		 397 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0176  tryptophan synthase subunit beta  55.78 
 
 		 430 aa  472  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  57.25 
 
 		 397 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0143  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 405 aa  472  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0201  tryptophan synthase subunit beta  56.28 
 
 		 413 aa  472  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>