More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1656 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  95.43 
 
 		 394 aa  779    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  98.48 
 
 		 394 aa  801    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 394 aa  812    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  97.97 
 
 		 394 aa  798    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  68.75 
 
 		 389 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  63.64 
 
 		 391 aa  543  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  64.51 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  63.73 
 
 		 414 aa  531  1e-150  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  65.97 
 
 		 394 aa  529  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  63.73 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  63.4 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  63.87 
 
 		 404 aa  519  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  62.02 
 
 		 401 aa  517  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.94 
 
 		 409 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  63.64 
 
 		 393 aa  514  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  62.08 
 
 		 396 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  63.4 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  62.63 
 
 		 397 aa  512  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  62.89 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 394 aa  513  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  63.4 
 
 		 397 aa  514  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1660  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 396 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014764 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  62.37 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  62.37 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  62.63 
 
 		 397 aa  511  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2726  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 396 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.93556  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  62.37 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2407  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 396 aa  509  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  60.26 
 
 		 409 aa  510  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  62.37 
 
 		 402 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1586  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 409 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0076  tryptophan synthase subunit beta  61.2 
 
 		 390 aa  509  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2805  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 396 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  63.12 
 
 		 402 aa  508  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2916  tryptophan synthase subunit beta  59.34 
 
 		 407 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.511307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 398 aa  505  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  61.3 
 
 		 396 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3023  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 396 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  61.3 
 
 		 396 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2705  tryptophan synthase subunit beta  58.87 
 
 		 396 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3622  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 426 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003084  tryptophan synthase beta chain  58.63 
 
 		 396 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2454  tryptophan synthase subunit beta  58.67 
 
 		 401 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2255  tryptophan synthase subunit beta  59.34 
 
 		 403 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0836198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1425  tryptophan synthase subunit beta  59.18 
 
 		 403 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  61.34 
 
 		 402 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02292  tryptophan synthase subunit beta  60.84 
 
 		 393 aa  506  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1682  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 407 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  60.89 
 
 		 405 aa  504  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1936  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 396 aa  501  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  60.52 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  61.44 
 
 		 406 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02762  tryptophan synthase subunit beta  58.52 
 
 		 396 aa  504  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  60.73 
 
 		 411 aa  503  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2128  tryptophan synthase, beta subunit  61.58 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0792  tryptophan synthase subunit beta  58.52 
 
 		 396 aa  502  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00347207  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1150  tryptophan synthase subunit beta  59.03 
 
 		 396 aa  504  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  61.78 
 
 		 406 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2833  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 395 aa  503  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1458  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1524  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0500753 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1516  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 		 411 aa  502  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0942  tryptophan synthase subunit beta  61.94 
 
 		 402 aa  500  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3843  tryptophan synthase subunit beta  62.3 
 
 		 394 aa  500  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  60.88 
 
 		 410 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1394  tryptophan synthase subunit beta  60.63 
 
 		 392 aa  498  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000239329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  60.05 
 
 		 402 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 		 404 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1433  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 404 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  60.99 
 
 		 401 aa  498  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1462  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 404 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2133  tryptophan synthase subunit beta  58.87 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.31152  normal  0.733883 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  61.78 
 
 		 409 aa  499  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  59.95 
 
 		 399 aa  499  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2003  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 396 aa  498  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  61.26 
 
 		 406 aa  497  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  60.63 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  59.33 
 
 		 406 aa  494  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1691  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 		 393 aa  496  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0223  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 388 aa  495  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 404 aa  497  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 399 aa  495  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 408 aa  497  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  61.78 
 
 		 404 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1790  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 391 aa  496  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  60.99 
 
 		 422 aa  495  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  61.78 
 
 		 404 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  61.14 
 
 		 410 aa  497  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 412 aa  497  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2302  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 395 aa  497  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 405 aa  498  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 403 aa  495  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 405 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0097  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 407 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0108  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 393 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0063  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 414 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>