More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1257 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  94.49 
 
 		 399 aa  775    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  100 
 
 		 399 aa  823    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  94.74 
 
 		 399 aa  779    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  68.24 
 
 		 409 aa  551  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  65.22 
 
 		 397 aa  544  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  65.04 
 
 		 391 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  64.02 
 
 		 413 aa  535  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  64.19 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 		 399 aa  531  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  64.66 
 
 		 414 aa  531  1e-150  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  64.96 
 
 		 396 aa  534  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  64.19 
 
 		 401 aa  532  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0166  tryptophan synthase subunit beta  64.41 
 
 		 414 aa  531  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0594261  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01841  tryptophan synthase subunit beta  64.41 
 
 		 414 aa  531  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 		 399 aa  531  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  62.72 
 
 		 402 aa  528  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  64.27 
 
 		 397 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  64.52 
 
 		 397 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  63.66 
 
 		 414 aa  530  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  63.57 
 
 		 397 aa  525  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  63.94 
 
 		 417 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  63.82 
 
 		 397 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  63.82 
 
 		 397 aa  525  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  63.82 
 
 		 397 aa  525  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  63.75 
 
 		 396 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  67.72 
 
 		 393 aa  527  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  63.68 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  63.82 
 
 		 397 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 397 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  64.54 
 
 		 400 aa  525  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  63.82 
 
 		 397 aa  525  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  64.27 
 
 		 397 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  64.27 
 
 		 397 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01931  tryptophan synthase subunit beta  63.82 
 
 		 414 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  64.71 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  64.27 
 
 		 397 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  63.75 
 
 		 397 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  63.82 
 
 		 397 aa  524  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  64.71 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  63.75 
 
 		 397 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  63.5 
 
 		 397 aa  521  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  63.75 
 
 		 397 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  63.75 
 
 		 397 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  63.59 
 
 		 420 aa  522  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  63.75 
 
 		 397 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 415 aa  521  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  63.75 
 
 		 397 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  63.38 
 
 		 402 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  64.01 
 
 		 409 aa  524  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  63.75 
 
 		 397 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  63.82 
 
 		 397 aa  524  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  63.75 
 
 		 397 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  62.66 
 
 		 397 aa  521  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  63.75 
 
 		 397 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  63.31 
 
 		 397 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  63.75 
 
 		 397 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  63.75 
 
 		 397 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  62.21 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2098  tryptophan synthase subunit beta  62.6 
 
 		 418 aa  519  1e-146  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  61.4 
 
 		 403 aa  518  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  63.59 
 
 		 413 aa  520  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  63.24 
 
 		 397 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  64.99 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  62.21 
 
 		 424 aa  519  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3701  tryptophan synthase subunit beta  63.17 
 
 		 396 aa  519  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  63.75 
 
 		 397 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  64.62 
 
 		 409 aa  521  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 404 aa  521  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  62.34 
 
 		 402 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1943  tryptophan synthase subunit beta  64.51 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.233821  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  64.95 
 
 		 415 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  63.24 
 
 		 403 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 		 403 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  63.24 
 
 		 399 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  61.7 
 
 		 394 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  63.12 
 
 		 410 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  61.06 
 
 		 406 aa  515  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 396 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 		 406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 394 aa  513  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  62.98 
 
 		 405 aa  513  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  62.21 
 
 		 412 aa  514  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  63.47 
 
 		 402 aa  511  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  61.86 
 
 		 411 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 396 aa  512  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  60.4 
 
 		 416 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  64.52 
 
 		 395 aa  514  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0222  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 399 aa  509  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.580627  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  61.95 
 
 		 399 aa  510  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  60.93 
 
 		 405 aa  508  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  61.7 
 
 		 411 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  61.18 
 
 		 408 aa  509  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  62.66 
 
 		 401 aa  510  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  61.03 
 
 		 409 aa  509  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  61.04 
 
 		 405 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 407 aa  511  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  61.7 
 
 		 406 aa  510  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  62.11 
 
 		 413 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>