More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3701 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  82.31 
 
 		 406 aa  663    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  84.02 
 
 		 406 aa  669    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3701  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 396 aa  805    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0222  tryptophan synthase subunit beta  73.97 
 
 		 399 aa  602  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.580627  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2688  tryptophan synthase subunit beta  67.87 
 
 		 408 aa  534  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  67.96 
 
 		 406 aa  531  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  66.93 
 
 		 409 aa  529  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  67.18 
 
 		 406 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1158  tryptophan synthase subunit beta  70.13 
 
 		 408 aa  526  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  66.07 
 
 		 406 aa  522  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  66.84 
 
 		 409 aa  523  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  62.78 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  66.07 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 406 aa  519  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  64.52 
 
 		 405 aa  520  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  63.17 
 
 		 399 aa  519  1e-146  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  66.07 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  66.07 
 
 		 406 aa  519  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  62.78 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  64.52 
 
 		 422 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  65.89 
 
 		 406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  65.3 
 
 		 409 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  65.35 
 
 		 410 aa  512  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 		 401 aa  513  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  64.01 
 
 		 391 aa  511  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  66.15 
 
 		 406 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  63.99 
 
 		 406 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  65.04 
 
 		 394 aa  510  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  65.04 
 
 		 404 aa  510  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  64.52 
 
 		 411 aa  511  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  65.37 
 
 		 420 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  65.12 
 
 		 420 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  63.75 
 
 		 402 aa  510  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  65.12 
 
 		 420 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  63.68 
 
 		 396 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  66.93 
 
 		 395 aa  506  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  64.74 
 
 		 399 aa  505  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  64.04 
 
 		 406 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  64.27 
 
 		 408 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  65.12 
 
 		 401 aa  507  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  63.24 
 
 		 403 aa  504  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  62.86 
 
 		 404 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0206  tryptophan synthase subunit beta  63.36 
 
 		 419 aa  505  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  65.04 
 
 		 410 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  63.73 
 
 		 406 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  64.57 
 
 		 402 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4976  tryptophan synthase subunit beta  67.35 
 
 		 410 aa  507  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  64.83 
 
 		 402 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  63.78 
 
 		 411 aa  501  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  63.36 
 
 		 405 aa  501  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 		 399 aa  503  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 		 399 aa  503  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0143  tryptophan synthase subunit beta  64.52 
 
 		 405 aa  504  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3585  tryptophan synthase subunit beta  64.03 
 
 		 409 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  64.01 
 
 		 418 aa  504  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  63.43 
 
 		 396 aa  504  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  63.75 
 
 		 404 aa  501  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3270  tryptophan synthase subunit beta  64.03 
 
 		 409 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.244666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  62.5 
 
 		 399 aa  501  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  64.01 
 
 		 404 aa  503  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 396 aa  501  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  64.12 
 
 		 410 aa  502  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  64.08 
 
 		 420 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  63.45 
 
 		 409 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3887  tryptophan synthase subunit beta  63.61 
 
 		 410 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.85731 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  62.92 
 
 		 409 aa  498  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  62.81 
 
 		 400 aa  501  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1031  tryptophan synthase subunit beta  62.92 
 
 		 410 aa  498  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.466116  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  64.34 
 
 		 420 aa  498  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  62.11 
 
 		 405 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  63.45 
 
 		 409 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  61.36 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  61.36 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  61.36 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  61.36 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.36 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  62.11 
 
 		 405 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  61.36 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  62.11 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 		 411 aa  495  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 397 aa  498  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  62.11 
 
 		 405 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  62.21 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  61.36 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  60.84 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2220  tryptophan synthase subunit beta  64.39 
 
 		 431 aa  492  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1872  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0911585 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 		 397 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  64.06 
 
 		 402 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 		 397 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  64.25 
 
 		 402 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  61.95 
 
 		 396 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  60.84 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0201  tryptophan synthase subunit beta  61.32 
 
 		 413 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  62.79 
 
 		 404 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 414 aa  493  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  61.04 
 
 		 398 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 		 397 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  60.25 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>