More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0222 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0222  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 399 aa  821    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.580627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  75.58 
 
 		 406 aa  615  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  75.52 
 
 		 406 aa  616  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3701  tryptophan synthase subunit beta  73.97 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142022 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  64.92 
 
 		 409 aa  526  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  63.32 
 
 		 409 aa  524  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  64.36 
 
 		 394 aa  519  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  63.2 
 
 		 404 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  63.85 
 
 		 418 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  62.6 
 
 		 405 aa  511  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 		 406 aa  511  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  63.33 
 
 		 406 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2688  tryptophan synthase subunit beta  61.81 
 
 		 408 aa  512  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  63.14 
 
 		 406 aa  512  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  63.24 
 
 		 406 aa  510  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 422 aa  510  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  60.41 
 
 		 399 aa  509  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 		 406 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  61.13 
 
 		 391 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 401 aa  505  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  63.47 
 
 		 408 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 399 aa  505  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  61.79 
 
 		 396 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 406 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  60.55 
 
 		 402 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  62.76 
 
 		 399 aa  502  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  61.4 
 
 		 414 aa  501  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 399 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4976  tryptophan synthase subunit beta  61.62 
 
 		 410 aa  501  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 397 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  60.66 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  60.91 
 
 		 404 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  60.87 
 
 		 409 aa  501  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 399 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  61.03 
 
 		 415 aa  501  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 396 aa  498  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  60.91 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 402 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  62.05 
 
 		 409 aa  501  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 403 aa  494  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 411 aa  497  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  59.33 
 
 		 406 aa  495  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  60.97 
 
 		 396 aa  495  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  63.73 
 
 		 402 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  62.82 
 
 		 420 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1031  tryptophan synthase subunit beta  60.87 
 
 		 410 aa  494  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.466116  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  61.89 
 
 		 401 aa  495  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  58.4 
 
 		 403 aa  496  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  60.25 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1158  tryptophan synthase subunit beta  65.08 
 
 		 408 aa  495  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  61.7 
 
 		 410 aa  498  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 		 420 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 406 aa  497  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 411 aa  495  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  61.15 
 
 		 411 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  62.02 
 
 		 406 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 		 420 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  59.33 
 
 		 406 aa  495  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  60.16 
 
 		 410 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  58.88 
 
 		 397 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  60.97 
 
 		 396 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  60.42 
 
 		 402 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  59.44 
 
 		 405 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 424 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  59.39 
 
 		 397 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  60.25 
 
 		 671 aa  491  9.999999999999999e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 404 aa  492  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  59.14 
 
 		 403 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  60.21 
 
 		 406 aa  490  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  59.14 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  61.08 
 
 		 394 aa  488  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  58.5 
 
 		 399 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  58.5 
 
 		 399 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1165  tryptophan synthase subunit beta  61.5 
 
 		 412 aa  488  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 399 aa  491  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  58.81 
 
 		 404 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  58.63 
 
 		 397 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 412 aa  490  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0201  tryptophan synthase subunit beta  58.02 
 
 		 413 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  59.14 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  59.33 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  59.14 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  61.54 
 
 		 420 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  60.93 
 
 		 396 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 410 aa  488  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2220  tryptophan synthase subunit beta  60.64 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  61.28 
 
 		 420 aa  491  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  60.77 
 
 		 434 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2054  tryptophan synthase, beta subunit  61.34 
 
 		 443 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  58.63 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  58.88 
 
 		 397 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3585  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 409 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0143  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 405 aa  488  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  58.38 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  58.63 
 
 		 407 aa  487  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  58.63 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  58.63 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>