More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2054 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  79.61 
 
 		 420 aa  681    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2054  tryptophan synthase, beta subunit  100 
 
 		 443 aa  897    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  79.13 
 
 		 420 aa  676    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  78.66 
 
 		 420 aa  677    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11628  tryptophan synthase subunit beta  78 
 
 		 410 aa  654    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2947  tryptophan synthase, beta subunit  82.4 
 
 		 455 aa  697    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.378076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  79.13 
 
 		 420 aa  676    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  78.18 
 
 		 420 aa  678    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5701  tryptophan synthase subunit beta  72.66 
 
 		 411 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.194969  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  72.91 
 
 		 449 aa  586  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  70.57 
 
 		 406 aa  581  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1165  tryptophan synthase subunit beta  72.52 
 
 		 412 aa  578  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2965  tryptophan synthase subunit beta  72.49 
 
 		 433 aa  569  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0872098  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3174  tryptophan synthase, beta subunit  70.53 
 
 		 405 aa  567  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3075  tryptophan synthase subunit beta  68.92 
 
 		 423 aa  559  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000212067  hitchhiker  0.000123729 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12890  tryptophan synthase subunit beta  68.7 
 
 		 418 aa  555  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal  0.0360199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1451  tryptophan synthase subunit beta  69.39 
 
 		 414 aa  555  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2940  Tryptophan synthase  69.64 
 
 		 414 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20740  tryptophan synthase, beta chain  68.26 
 
 		 415 aa  553  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133254  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2220  tryptophan synthase subunit beta  66.1 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3016  tryptophan synthase subunit beta  70.05 
 
 		 445 aa  550  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0445574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2874  tryptophan synthase, beta subunit  67.64 
 
 		 424 aa  548  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000102135  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1216  tryptophan synthase subunit beta  68.01 
 
 		 414 aa  545  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.268288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1688  tryptophan synthase subunit beta  67.5 
 
 		 443 aa  546  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1932  tryptophan synthase subunit beta  70.18 
 
 		 490 aa  547  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0489987  normal  0.581872 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1074  tryptophan synthase subunit beta  68.54 
 
 		 425 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.32093  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1683  tryptophan synthase subunit beta  65.5 
 
 		 442 aa  536  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000190343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2510  tryptophan synthase subunit beta  65.58 
 
 		 406 aa  529  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3171  tryptophan synthase subunit beta  66.25 
 
 		 410 aa  529  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0140  tryptophan synthase subunit beta  62.79 
 
 		 433 aa  527  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3396  tryptophan synthase subunit beta  65.91 
 
 		 410 aa  527  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14900  tryptophan synthase subunit beta  69.13 
 
 		 448 aa  522  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.412247  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 		 405 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  64.23 
 
 		 399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.86 
 
 		 409 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  64.49 
 
 		 401 aa  513  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1500  tryptophan synthase, beta subunit  65.15 
 
 		 426 aa  509  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  61.64 
 
 		 406 aa  508  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  62.66 
 
 		 409 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5710  tryptophan synthase subunit beta  66.01 
 
 		 440 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  61.64 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  61.89 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  61.64 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  61.64 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  61.13 
 
 		 406 aa  504  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  64.74 
 
 		 404 aa  507  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  61.13 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  60.82 
 
 		 391 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  61.22 
 
 		 400 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  62.24 
 
 		 411 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  61.13 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  59.85 
 
 		 402 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  61.89 
 
 		 399 aa  504  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 		 428 aa  504  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  63.8 
 
 		 394 aa  504  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  61.13 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  60.87 
 
 		 422 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 		 410 aa  504  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3026  tryptophan synthase subunit beta  62.05 
 
 		 426 aa  503  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1985  tryptophan synthase, beta subunit  64.48 
 
 		 422 aa  500  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 406 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  57.89 
 
 		 409 aa  499  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 		 402 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01270  tryptophan synthase subunit beta  60.9 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 403 aa  497  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10970  tryptophan synthase subunit beta  60.43 
 
 		 441 aa  495  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0274745  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 399 aa  495  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 403 aa  496  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  57.42 
 
 		 447 aa  495  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 399 aa  495  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  62.04 
 
 		 406 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  60.87 
 
 		 411 aa  495  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  60.16 
 
 		 402 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  60.66 
 
 		 410 aa  495  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 434 aa  497  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 397 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  59.01 
 
 		 412 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 		 405 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 397 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  60.42 
 
 		 406 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 405 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 401 aa  492  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  60.72 
 
 		 398 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  59.17 
 
 		 399 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  61.15 
 
 		 406 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4976  tryptophan synthase subunit beta  60.91 
 
 		 410 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 403 aa  492  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 397 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>