More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1683 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0140  tryptophan synthase subunit beta  83.13 
 
 
433 aa  712    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1683  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 
442 aa  902    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000190343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1688  tryptophan synthase subunit beta  91.65 
 
 
443 aa  832    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20740  tryptophan synthase, beta chain  71.53 
 
 
415 aa  619  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133254  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1216  tryptophan synthase subunit beta  70.26 
 
 
414 aa  617  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.268288  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10970  tryptophan synthase subunit beta  69.1 
 
 
441 aa  612  9.999999999999999e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0274745  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1500  tryptophan synthase, beta subunit  71.7 
 
 
426 aa  605  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2220  tryptophan synthase subunit beta  69.18 
 
 
431 aa  603  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1985  tryptophan synthase, beta subunit  69.5 
 
 
422 aa  589  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  68.2 
 
 
449 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2965  tryptophan synthase subunit beta  69.12 
 
 
433 aa  584  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0872098  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  69.52 
 
 
406 aa  577  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5701  tryptophan synthase subunit beta  69.95 
 
 
411 aa  574  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.194969  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3174  tryptophan synthase, beta subunit  67.25 
 
 
405 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1165  tryptophan synthase subunit beta  67.41 
 
 
412 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  68.42 
 
 
420 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  68.67 
 
 
420 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  68.42 
 
 
420 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  68.34 
 
 
420 aa  565  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  68.09 
 
 
420 aa  567  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2874  tryptophan synthase, beta subunit  67.64 
 
 
424 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000102135  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2947  tryptophan synthase, beta subunit  67.55 
 
 
455 aa  564  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.378076  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11628  tryptophan synthase subunit beta  67.8 
 
 
410 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.246172 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12890  tryptophan synthase subunit beta  66.75 
 
 
418 aa  560  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal  0.0360199 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14900  tryptophan synthase subunit beta  69.04 
 
 
448 aa  560  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.412247  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3396  tryptophan synthase subunit beta  67.25 
 
 
410 aa  555  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2940  Tryptophan synthase  67.59 
 
 
414 aa  555  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1074  tryptophan synthase subunit beta  66.92 
 
 
425 aa  557  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.32093  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1451  tryptophan synthase subunit beta  66.33 
 
 
414 aa  553  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3171  tryptophan synthase subunit beta  66.75 
 
 
410 aa  551  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3075  tryptophan synthase subunit beta  67.66 
 
 
423 aa  548  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000212067  hitchhiker  0.000123729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5710  tryptophan synthase subunit beta  68.32 
 
 
440 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2054  tryptophan synthase, beta subunit  65.5 
 
 
443 aa  536  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2510  tryptophan synthase subunit beta  66.33 
 
 
406 aa  538  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3026  tryptophan synthase subunit beta  67.75 
 
 
426 aa  535  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  64.54 
 
 
403 aa  528  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  65.56 
 
 
409 aa  522  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  64.19 
 
 
418 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  62.76 
 
 
397 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  62.76 
 
 
397 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  61.99 
 
 
397 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01270  tryptophan synthase subunit beta  63.94 
 
 
405 aa  513  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  61.77 
 
 
406 aa  510  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3016  tryptophan synthase subunit beta  64.16 
 
 
445 aa  510  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0445574 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  61.48 
 
 
397 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  61.48 
 
 
397 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  61.48 
 
 
397 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  62.5 
 
 
405 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  61.52 
 
 
406 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  60.87 
 
 
399 aa  506  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  60.87 
 
 
399 aa  506  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0870  tryptophan synthase subunit beta  61.73 
 
 
399 aa  504  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318108 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  61.48 
 
 
397 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  61.48 
 
 
397 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  61.73 
 
 
397 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  61.52 
 
 
422 aa  507  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  61.22 
 
 
403 aa  502  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  61.73 
 
 
397 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  61.22 
 
 
397 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  61.48 
 
 
397 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 
397 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  61.22 
 
 
397 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 
397 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  61.22 
 
 
397 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  61.99 
 
 
401 aa  501  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  62.16 
 
 
402 aa  502  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  61.22 
 
 
400 aa  504  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  60.82 
 
 
409 aa  504  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1932  tryptophan synthase subunit beta  63.41 
 
 
490 aa  502  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0489987  normal  0.581872 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  61.22 
 
 
397 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0728  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 
405 aa  502  1e-141  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0644  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 
405 aa  502  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  61.89 
 
 
405 aa  501  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  61.22 
 
 
397 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  61.22 
 
 
397 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 
397 aa  498  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  61.99 
 
 
399 aa  498  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  62.09 
 
 
394 aa  499  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  61.48 
 
 
397 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 
399 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  59.12 
 
 
409 aa  495  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  61.89 
 
 
394 aa  496  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 
401 aa  495  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 
399 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 
407 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  60.97 
 
 
411 aa  495  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 
403 aa  497  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4200  tryptophan synthase subunit beta  62.95 
 
 
434 aa  491  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0203217  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  60.87 
 
 
404 aa  492  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 
406 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  61.64 
 
 
406 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  61.64 
 
 
403 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  58.4 
 
 
405 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  61.01 
 
 
406 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 
406 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  62.27 
 
 
393 aa  493  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  60.82 
 
 
411 aa  490  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4057  tryptophan synthase subunit beta  62.95 
 
 
431 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  59.45 
 
 
404 aa  490  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  57.89 
 
 
405 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>