More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_10970 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_10970  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 
441 aa  897    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0274745  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1688  tryptophan synthase subunit beta  72.46 
 
 
443 aa  619  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1683  tryptophan synthase subunit beta  69.1 
 
 
442 aa  612  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000190343 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2220  tryptophan synthase subunit beta  72.77 
 
 
431 aa  595  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0140  tryptophan synthase subunit beta  68.82 
 
 
433 aa  596  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20740  tryptophan synthase, beta chain  68.32 
 
 
415 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133254  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1985  tryptophan synthase, beta subunit  69.01 
 
 
422 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1500  tryptophan synthase, beta subunit  68.79 
 
 
426 aa  568  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2965  tryptophan synthase subunit beta  69.02 
 
 
433 aa  565  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0872098  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1216  tryptophan synthase subunit beta  66.83 
 
 
414 aa  565  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.268288  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3174  tryptophan synthase, beta subunit  69.46 
 
 
405 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  69.27 
 
 
406 aa  556  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  67.47 
 
 
449 aa  550  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2874  tryptophan synthase, beta subunit  69.92 
 
 
424 aa  550  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000102135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5701  tryptophan synthase subunit beta  66.58 
 
 
411 aa  549  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.194969  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1165  tryptophan synthase subunit beta  66.01 
 
 
412 aa  545  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5710  tryptophan synthase subunit beta  72.08 
 
 
440 aa  544  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14900  tryptophan synthase subunit beta  68.97 
 
 
448 aa  544  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.412247  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12890  tryptophan synthase subunit beta  67.89 
 
 
418 aa  541  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal  0.0360199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3396  tryptophan synthase subunit beta  64.22 
 
 
410 aa  533  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  63.74 
 
 
420 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1074  tryptophan synthase subunit beta  65.76 
 
 
425 aa  534  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.32093  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  63.74 
 
 
420 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  63.25 
 
 
420 aa  528  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  63.74 
 
 
420 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  63.25 
 
 
420 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2940  Tryptophan synthase  65.49 
 
 
414 aa  524  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3171  tryptophan synthase subunit beta  65.58 
 
 
410 aa  524  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2510  tryptophan synthase subunit beta  64.07 
 
 
406 aa  522  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3075  tryptophan synthase subunit beta  64.29 
 
 
423 aa  521  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000212067  hitchhiker  0.000123729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1451  tryptophan synthase subunit beta  65.24 
 
 
414 aa  518  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3026  tryptophan synthase subunit beta  65.77 
 
 
426 aa  518  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1932  tryptophan synthase subunit beta  64.58 
 
 
490 aa  512  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0489987  normal  0.581872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11628  tryptophan synthase subunit beta  63.61 
 
 
410 aa  513  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.246172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2947  tryptophan synthase, beta subunit  65 
 
 
455 aa  514  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.378076  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3016  tryptophan synthase subunit beta  66.08 
 
 
445 aa  509  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0445574 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 
409 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  59.55 
 
 
399 aa  494  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  59.55 
 
 
399 aa  494  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2054  tryptophan synthase, beta subunit  60.43 
 
 
443 aa  495  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 
418 aa  498  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  61.31 
 
 
401 aa  492  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 
399 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 
404 aa  488  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 
399 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  59.55 
 
 
403 aa  489  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  58.94 
 
 
391 aa  488  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01270  tryptophan synthase subunit beta  58.17 
 
 
405 aa  485  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  61.81 
 
 
394 aa  485  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  62.09 
 
 
401 aa  485  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  60.89 
 
 
402 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 
405 aa  484  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 
410 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  58.72 
 
 
409 aa  481  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  59.27 
 
 
410 aa  482  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  60.25 
 
 
411 aa  484  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  59.8 
 
 
405 aa  483  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  59.05 
 
 
397 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 
402 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  59.55 
 
 
397 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 
402 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  59.08 
 
 
406 aa  475  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  59.3 
 
 
397 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  58.97 
 
 
403 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3843  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 
394 aa  475  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  59.6 
 
 
406 aa  477  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  60.05 
 
 
402 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  58.16 
 
 
409 aa  476  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  59.05 
 
 
407 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 
411 aa  475  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 
401 aa  478  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  60.56 
 
 
394 aa  478  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4200  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 
434 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0203217  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  60.3 
 
 
403 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  56.68 
 
 
394 aa  473  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  57.32 
 
 
406 aa  474  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  59.19 
 
 
396 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  59.75 
 
 
404 aa  473  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  58.29 
 
 
397 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  59.6 
 
 
406 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  58.54 
 
 
397 aa  471  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4057  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 
431 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  57.07 
 
 
422 aa  473  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  58.54 
 
 
406 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  58.29 
 
 
397 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  56.93 
 
 
393 aa  472  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  57.79 
 
 
410 aa  472  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  58.29 
 
 
397 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  57.07 
 
 
406 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  58.96 
 
 
405 aa  471  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  57.68 
 
 
403 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  59.24 
 
 
399 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 
413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  58.29 
 
 
397 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  58.29 
 
 
406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  59.3 
 
 
397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  58.78 
 
 
402 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  58 
 
 
413 aa  470  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  59.05 
 
 
397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  58.79 
 
 
397 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>