More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3171 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3396  tryptophan synthase subunit beta  94.88 
 
 		 410 aa  786    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3171  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 410 aa  828    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2510  tryptophan synthase subunit beta  71.21 
 
 		 406 aa  586  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2874  tryptophan synthase, beta subunit  73.18 
 
 		 424 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000102135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5710  tryptophan synthase subunit beta  73.27 
 
 		 440 aa  578  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20740  tryptophan synthase, beta chain  71.9 
 
 		 415 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133254  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3026  tryptophan synthase subunit beta  70.39 
 
 		 426 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1165  tryptophan synthase subunit beta  71.65 
 
 		 412 aa  564  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3174  tryptophan synthase, beta subunit  71.43 
 
 		 405 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  71.25 
 
 		 449 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2965  tryptophan synthase subunit beta  72.12 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0872098  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1683  tryptophan synthase subunit beta  66.75 
 
 		 442 aa  551  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000190343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1688  tryptophan synthase subunit beta  67.25 
 
 		 443 aa  552  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5701  tryptophan synthase subunit beta  69.12 
 
 		 411 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.194969  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  68.16 
 
 		 420 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1216  tryptophan synthase subunit beta  68.54 
 
 		 414 aa  547  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.268288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  67.83 
 
 		 406 aa  545  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  67.91 
 
 		 420 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1074  tryptophan synthase subunit beta  70.89 
 
 		 425 aa  545  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.32093  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  67.91 
 
 		 420 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1985  tryptophan synthase, beta subunit  68.51 
 
 		 422 aa  544  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2220  tryptophan synthase subunit beta  67.5 
 
 		 431 aa  538  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1500  tryptophan synthase, beta subunit  68.61 
 
 		 426 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2940  Tryptophan synthase  68.86 
 
 		 414 aa  537  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  65.84 
 
 		 420 aa  535  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  66.33 
 
 		 420 aa  531  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11628  tryptophan synthase subunit beta  65.22 
 
 		 410 aa  534  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246172 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0140  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 433 aa  533  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2054  tryptophan synthase, beta subunit  66.25 
 
 		 443 aa  529  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1932  tryptophan synthase subunit beta  70.74 
 
 		 490 aa  525  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0489987  normal  0.581872 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  65.91 
 
 		 409 aa  525  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1451  tryptophan synthase subunit beta  67.85 
 
 		 414 aa  524  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10970  tryptophan synthase subunit beta  65.58 
 
 		 441 aa  524  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0274745  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14900  tryptophan synthase subunit beta  68.43 
 
 		 448 aa  521  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.412247  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2947  tryptophan synthase, beta subunit  65.09 
 
 		 455 aa  519  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.378076  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3016  tryptophan synthase subunit beta  68.67 
 
 		 445 aa  513  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0445574 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 		 418 aa  512  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  63.54 
 
 		 403 aa  513  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  63.29 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  63.38 
 
 		 405 aa  510  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3075  tryptophan synthase subunit beta  67.51 
 
 		 423 aa  511  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000212067  hitchhiker  0.000123729 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  63.29 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  63.8 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  63.04 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  63.29 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  63.29 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  62.03 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0870  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 		 399 aa  507  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  63.54 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  64.18 
 
 		 407 aa  508  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  62.03 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  63.54 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01270  tryptophan synthase subunit beta  64.27 
 
 		 405 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  63.54 
 
 		 403 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  63.4 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  62.78 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  62.28 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  60.2 
 
 		 409 aa  501  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  62.53 
 
 		 397 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  62.78 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  62.53 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  62.28 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  62.53 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  62.53 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  62.22 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  62.53 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  62.53 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0728  tryptophan synthase subunit beta  62.65 
 
 		 405 aa  494  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  62.28 
 
 		 399 aa  495  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0644  tryptophan synthase subunit beta  62.65 
 
 		 405 aa  497  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  62.53 
 
 		 397 aa  498  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  63.48 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  62.53 
 
 		 397 aa  498  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5243  tryptophan synthase subunit beta  61.73 
 
 		 418 aa  491  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  62.03 
 
 		 394 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  59.25 
 
 		 413 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  64.45 
 
 		 404 aa  491  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  58.68 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  61.56 
 
 		 402 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12890  tryptophan synthase subunit beta  64.65 
 
 		 418 aa  493  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal  0.0360199 
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  61.01 
 
 		 406 aa  489  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 399 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 399 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  60.76 
 
 		 422 aa  488  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  60.76 
 
 		 406 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  61.34 
 
 		 402 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  61.27 
 
 		 396 aa  489  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 414 aa  485  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 406 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  61.01 
 
 		 396 aa  487  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  61 
 
 		 402 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  62.37 
 
 		 400 aa  485  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  61.28 
 
 		 424 aa  484  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  60.25 
 
 		 410 aa  485  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  61.34 
 
 		 402 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  59.2 
 
 		 409 aa  485  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 397 aa  487  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  59.24 
 
 		 397 aa  484  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 396 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>