More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5710 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5710  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 440 aa  889    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2874  tryptophan synthase, beta subunit  75.12 
 
 		 424 aa  598  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000102135  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3396  tryptophan synthase subunit beta  73.51 
 
 		 410 aa  595  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3171  tryptophan synthase subunit beta  73.27 
 
 		 410 aa  593  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1165  tryptophan synthase subunit beta  71.43 
 
 		 412 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3174  tryptophan synthase, beta subunit  72 
 
 		 405 aa  568  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10970  tryptophan synthase subunit beta  72.08 
 
 		 441 aa  561  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0274745  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1683  tryptophan synthase subunit beta  68.32 
 
 		 442 aa  557  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000190343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2510  tryptophan synthase subunit beta  67.83 
 
 		 406 aa  551  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20740  tryptophan synthase, beta chain  69 
 
 		 415 aa  552  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133254  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1216  tryptophan synthase subunit beta  68.01 
 
 		 414 aa  550  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.268288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2220  tryptophan synthase subunit beta  68.81 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1688  tryptophan synthase subunit beta  70 
 
 		 443 aa  551  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  68.47 
 
 		 449 aa  545  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11628  tryptophan synthase subunit beta  69.04 
 
 		 410 aa  546  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2940  Tryptophan synthase  68.42 
 
 		 414 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  69.23 
 
 		 420 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1074  tryptophan synthase subunit beta  67.73 
 
 		 425 aa  544  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.32093  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  68.98 
 
 		 420 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0140  tryptophan synthase subunit beta  69.41 
 
 		 433 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  68.98 
 
 		 420 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2965  tryptophan synthase subunit beta  69.41 
 
 		 433 aa  536  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0872098  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5701  tryptophan synthase subunit beta  67 
 
 		 411 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.194969  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1451  tryptophan synthase subunit beta  67.92 
 
 		 414 aa  532  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  68.92 
 
 		 420 aa  531  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1932  tryptophan synthase subunit beta  69.67 
 
 		 490 aa  532  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0489987  normal  0.581872 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  68.26 
 
 		 406 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  66.11 
 
 		 420 aa  533  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3026  tryptophan synthase subunit beta  70.91 
 
 		 426 aa  530  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2054  tryptophan synthase, beta subunit  66.01 
 
 		 443 aa  525  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2947  tryptophan synthase, beta subunit  67.58 
 
 		 455 aa  526  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.378076  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3016  tryptophan synthase subunit beta  68.67 
 
 		 445 aa  523  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0445574 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14900  tryptophan synthase subunit beta  65.5 
 
 		 448 aa  519  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.412247  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1500  tryptophan synthase, beta subunit  67.33 
 
 		 426 aa  520  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3075  tryptophan synthase subunit beta  67.25 
 
 		 423 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000212067  hitchhiker  0.000123729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1985  tryptophan synthase, beta subunit  67.35 
 
 		 422 aa  514  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  61.75 
 
 		 399 aa  505  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  61.75 
 
 		 399 aa  505  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12890  tryptophan synthase subunit beta  65.82 
 
 		 418 aa  502  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal  0.0360199 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  60.3 
 
 		 418 aa  496  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 403 aa  498  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  60.35 
 
 		 406 aa  491  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  61.69 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  60.6 
 
 		 406 aa  494  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  60.85 
 
 		 401 aa  491  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.14 
 
 		 409 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 422 aa  489  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  61.27 
 
 		 394 aa  485  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 405 aa  484  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 403 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  59.2 
 
 		 397 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  59.2 
 
 		 397 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  59 
 
 		 397 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  59.75 
 
 		 397 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01270  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 405 aa  484  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  59.2 
 
 		 397 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  59.25 
 
 		 397 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  59.2 
 
 		 397 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  59.2 
 
 		 397 aa  481  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  59.1 
 
 		 396 aa  478  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  59.45 
 
 		 397 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  59.75 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  59.45 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  59.2 
 
 		 407 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  59.8 
 
 		 399 aa  480  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  59.8 
 
 		 399 aa  480  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  59.45 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5243  tryptophan synthase subunit beta  59.75 
 
 		 418 aa  481  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 396 aa  477  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  59 
 
 		 397 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  59 
 
 		 397 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  59.25 
 
 		 397 aa  478  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  60.4 
 
 		 402 aa  474  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  59 
 
 		 397 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  59 
 
 		 397 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0222  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 399 aa  477  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.580627  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  58.96 
 
 		 403 aa  475  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  58.02 
 
 		 409 aa  476  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 411 aa  476  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  59 
 
 		 397 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  59 
 
 		 397 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1215  tryptophan synthase subunit beta  58.92 
 
 		 422 aa  475  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236312 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  59 
 
 		 397 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  58.6 
 
 		 396 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  58.65 
 
 		 406 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  59.1 
 
 		 409 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  59.1 
 
 		 405 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  58.9 
 
 		 406 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  58.87 
 
 		 401 aa  471  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  58.31 
 
 		 409 aa  472  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 400 aa  474  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2592  tryptophan synthase subunit beta  58.19 
 
 		 422 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  58.42 
 
 		 411 aa  471  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  56.82 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  58.46 
 
 		 402 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3239  tryptophan synthase subunit beta  58.19 
 
 		 422 aa  472  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  59.44 
 
 		 410 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>