More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3239 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5243  tryptophan synthase subunit beta  89.07 
 
 		 418 aa  781    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  77.36 
 
 		 403 aa  660    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  82.82 
 
 		 428 aa  725    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  77.36 
 
 		 403 aa  651    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  76.69 
 
 		 397 aa  646    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  76.25 
 
 		 397 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  74.75 
 
 		 397 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  75.12 
 
 		 397 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  75.25 
 
 		 397 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  76.37 
 
 		 397 aa  657    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1788  tryptophan synthase subunit beta  85.07 
 
 		 435 aa  746    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  75.86 
 
 		 400 aa  650    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  86.63 
 
 		 447 aa  755    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  74.88 
 
 		 397 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1415  tryptophan synthase subunit beta  87.86 
 
 		 425 aa  774    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  76.62 
 
 		 397 aa  659    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  74.63 
 
 		 397 aa  636    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3239  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 422 aa  877    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4868  tryptophan synthase subunit beta  85.41 
 
 		 421 aa  753    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  76.94 
 
 		 397 aa  645    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2592  tryptophan synthase subunit beta  99.53 
 
 		 422 aa  872    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  86.94 
 
 		 434 aa  760    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1215  tryptophan synthase subunit beta  91.71 
 
 		 422 aa  810    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  81.53 
 
 		 412 aa  707    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  74.75 
 
 		 397 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  75.37 
 
 		 397 aa  633  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  74.38 
 
 		 397 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  74.5 
 
 		 397 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  74.38 
 
 		 397 aa  633  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  74.75 
 
 		 397 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  74.75 
 
 		 397 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  74.25 
 
 		 397 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  74.88 
 
 		 407 aa  634  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  74.38 
 
 		 397 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  74.75 
 
 		 397 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  74.75 
 
 		 397 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  74.38 
 
 		 397 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  74 
 
 		 397 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0870  tryptophan synthase subunit beta  75.06 
 
 		 399 aa  625  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318108 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  73.43 
 
 		 399 aa  610  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  72.18 
 
 		 409 aa  605  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  68.64 
 
 		 398 aa  591  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  69.25 
 
 		 405 aa  588  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  68.51 
 
 		 402 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  68.92 
 
 		 394 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  67.83 
 
 		 403 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  67.25 
 
 		 399 aa  570  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  67.25 
 
 		 399 aa  570  1e-161  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  66.75 
 
 		 399 aa  568  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  66.75 
 
 		 399 aa  568  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  66.01 
 
 		 411 aa  570  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  66.42 
 
 		 424 aa  566  1e-160  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  66.42 
 
 		 424 aa  564  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  65.91 
 
 		 415 aa  561  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  67.67 
 
 		 418 aa  558  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  66.17 
 
 		 406 aa  556  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  65.76 
 
 		 401 aa  553  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  66.08 
 
 		 403 aa  550  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  66.75 
 
 		 409 aa  546  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  65.5 
 
 		 396 aa  548  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  63.91 
 
 		 396 aa  541  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  65.99 
 
 		 405 aa  542  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1261  tryptophan synthase subunit beta  64.5 
 
 		 404 aa  543  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  63.66 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  63.41 
 
 		 397 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  65.39 
 
 		 411 aa  538  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  63.73 
 
 		 411 aa  536  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  65.74 
 
 		 404 aa  534  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01270  tryptophan synthase subunit beta  64 
 
 		 405 aa  535  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  65.15 
 
 		 404 aa  533  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  63.91 
 
 		 404 aa  529  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0644  tryptophan synthase subunit beta  63.73 
 
 		 405 aa  525  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0728  tryptophan synthase subunit beta  63.98 
 
 		 405 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  64.23 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  62.16 
 
 		 410 aa  526  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  64.18 
 
 		 410 aa  527  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  64.66 
 
 		 409 aa  524  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  63.32 
 
 		 406 aa  521  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  63.29 
 
 		 402 aa  522  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  61.6 
 
 		 405 aa  521  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  63.57 
 
 		 402 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  62.84 
 
 		 396 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  62.6 
 
 		 409 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  61.32 
 
 		 405 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3887  tryptophan synthase subunit beta  63.43 
 
 		 410 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.85731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  64.23 
 
 		 406 aa  518  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  63.17 
 
 		 402 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  63.09 
 
 		 396 aa  518  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  63.36 
 
 		 406 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  61.35 
 
 		 406 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  61.36 
 
 		 391 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  62.06 
 
 		 406 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 		 410 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  62.41 
 
 		 408 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  62.09 
 
 		 406 aa  515  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0206  tryptophan synthase subunit beta  61.37 
 
 		 419 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  63.22 
 
 		 406 aa  517  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  63.45 
 
 		 396 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  63.48 
 
 		 406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 		 406 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>