More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4868 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  77.61 
 
 		 403 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3239  tryptophan synthase subunit beta  85.41 
 
 		 422 aa  753    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  76.94 
 
 		 397 aa  638    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  81.82 
 
 		 428 aa  722    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1788  tryptophan synthase subunit beta  83.37 
 
 		 435 aa  734    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  81.71 
 
 		 447 aa  710    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  79.86 
 
 		 412 aa  694    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  77.19 
 
 		 397 aa  639    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1415  tryptophan synthase subunit beta  82.9 
 
 		 425 aa  731    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2592  tryptophan synthase subunit beta  85.41 
 
 		 422 aa  751    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4868  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 421 aa  870    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  82.78 
 
 		 434 aa  717    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5243  tryptophan synthase subunit beta  82.38 
 
 		 418 aa  732    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  75.99 
 
 		 403 aa  636    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1215  tryptophan synthase subunit beta  84.93 
 
 		 422 aa  743    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236312 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  76.44 
 
 		 397 aa  632  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  74.88 
 
 		 397 aa  630  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  73.45 
 
 		 400 aa  628  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  75.19 
 
 		 397 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  75.19 
 
 		 397 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  75.19 
 
 		 397 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  75.19 
 
 		 397 aa  626  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  74.88 
 
 		 397 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  75.19 
 
 		 397 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  75.19 
 
 		 397 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  75.19 
 
 		 397 aa  624  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  74.94 
 
 		 397 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  73.57 
 
 		 397 aa  622  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  75.12 
 
 		 407 aa  622  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  73.82 
 
 		 397 aa  624  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  74.13 
 
 		 397 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  74.69 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  74.38 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  74.38 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  74.38 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  74.94 
 
 		 397 aa  615  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  73.88 
 
 		 397 aa  617  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  74.19 
 
 		 397 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0870  tryptophan synthase subunit beta  74.07 
 
 		 399 aa  608  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318108 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  73.48 
 
 		 399 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  70.62 
 
 		 398 aa  591  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  71.18 
 
 		 409 aa  593  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  68.69 
 
 		 402 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  69.17 
 
 		 405 aa  579  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  68.69 
 
 		 394 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  68.16 
 
 		 399 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  68.16 
 
 		 399 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 399 aa  562  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 399 aa  562  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  66.33 
 
 		 411 aa  558  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  65.75 
 
 		 403 aa  555  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  65.91 
 
 		 401 aa  553  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  65.16 
 
 		 424 aa  545  1e-154  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  66.92 
 
 		 418 aa  546  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  64.66 
 
 		 406 aa  547  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  66.24 
 
 		 409 aa  543  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  64.91 
 
 		 415 aa  542  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1261  tryptophan synthase subunit beta  64.43 
 
 		 404 aa  542  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  65.16 
 
 		 424 aa  544  1e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01270  tryptophan synthase subunit beta  65.91 
 
 		 405 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  64.09 
 
 		 396 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 405 aa  537  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  65 
 
 		 410 aa  535  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  62.81 
 
 		 405 aa  534  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0728  tryptophan synthase subunit beta  65.91 
 
 		 405 aa  531  1e-150  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  64.9 
 
 		 403 aa  533  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  62.91 
 
 		 397 aa  534  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0644  tryptophan synthase subunit beta  65.66 
 
 		 405 aa  529  1e-149  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 		 411 aa  528  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  61.35 
 
 		 397 aa  525  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  63.07 
 
 		 402 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  62.94 
 
 		 406 aa  522  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  62.91 
 
 		 396 aa  522  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 404 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  62.66 
 
 		 404 aa  522  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  62.31 
 
 		 402 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  64.81 
 
 		 404 aa  524  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 		 406 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  61.1 
 
 		 396 aa  518  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  63.91 
 
 		 409 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  63.5 
 
 		 409 aa  521  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  63.18 
 
 		 406 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3887  tryptophan synthase subunit beta  63.5 
 
 		 410 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.85731 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0206  tryptophan synthase subunit beta  62.5 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  61.4 
 
 		 410 aa  519  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  62.91 
 
 		 396 aa  521  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  61.69 
 
 		 406 aa  519  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  60.99 
 
 		 409 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3585  tryptophan synthase subunit beta  62.75 
 
 		 409 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  61.94 
 
 		 406 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  61.98 
 
 		 404 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  61.73 
 
 		 404 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  61.71 
 
 		 411 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  63 
 
 		 396 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3270  tryptophan synthase subunit beta  62.75 
 
 		 409 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.244666 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  62.06 
 
 		 402 aa  512  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 		 404 aa  511  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  61.44 
 
 		 406 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 406 aa  514  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>