More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1249 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  100 
 
 
409 aa  835    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  69.61 
 
 
397 aa  578  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  68.56 
 
 
401 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  68.32 
 
 
413 aa  574  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  69.35 
 
 
407 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  70.91 
 
 
412 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  68.31 
 
 
397 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  68.05 
 
 
397 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  68.32 
 
 
413 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  68.31 
 
 
397 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  68.31 
 
 
397 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  68.31 
 
 
397 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  68.83 
 
 
397 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  68.31 
 
 
397 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  67.79 
 
 
397 aa  571  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  69.09 
 
 
397 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  67.79 
 
 
397 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  68.05 
 
 
397 aa  570  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  68.83 
 
 
399 aa  568  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  68.05 
 
 
397 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  67.53 
 
 
397 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  68.56 
 
 
418 aa  570  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  68.05 
 
 
397 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  68.83 
 
 
399 aa  568  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  68.05 
 
 
397 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  69.09 
 
 
397 aa  566  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  67.33 
 
 
409 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  68.99 
 
 
403 aa  567  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  68.83 
 
 
397 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  68.83 
 
 
397 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  68.05 
 
 
406 aa  564  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  69.39 
 
 
415 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  68.57 
 
 
403 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  70.13 
 
 
395 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  67.78 
 
 
403 aa  564  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  66.75 
 
 
397 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  67.01 
 
 
397 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  66.92 
 
 
397 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 
397 aa  558  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 
397 aa  558  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 
397 aa  559  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  67.45 
 
 
391 aa  558  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  69.09 
 
 
396 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  67.77 
 
 
397 aa  558  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  68.21 
 
 
413 aa  558  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 
397 aa  558  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  68.31 
 
 
401 aa  558  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  67.79 
 
 
397 aa  560  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  66.32 
 
 
424 aa  558  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  67.01 
 
 
396 aa  559  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  66.84 
 
 
402 aa  558  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  68.56 
 
 
434 aa  559  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  68.68 
 
 
399 aa  555  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  67.27 
 
 
405 aa  556  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  66.16 
 
 
397 aa  556  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  68.91 
 
 
417 aa  556  1e-157  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  66.07 
 
 
424 aa  555  1e-157  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  67.51 
 
 
397 aa  557  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  68.38 
 
 
399 aa  557  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  66.41 
 
 
397 aa  555  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1261  tryptophan synthase subunit beta  66.41 
 
 
404 aa  556  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  68.91 
 
 
402 aa  557  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  68.57 
 
 
428 aa  552  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  66.92 
 
 
404 aa  552  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  66.41 
 
 
399 aa  552  1e-156  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  66.41 
 
 
399 aa  552  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0870  tryptophan synthase subunit beta  67.96 
 
 
399 aa  551  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  67.27 
 
 
394 aa  552  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  68.24 
 
 
399 aa  551  1e-156  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  68.64 
 
 
399 aa  551  1e-156  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  67.36 
 
 
400 aa  553  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  67.78 
 
 
447 aa  553  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  66.32 
 
 
415 aa  553  1e-156  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1415  tryptophan synthase subunit beta  66.84 
 
 
425 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  65.9 
 
 
397 aa  554  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  66.16 
 
 
397 aa  554  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  65.54 
 
 
414 aa  550  1e-155  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  65.19 
 
 
396 aa  550  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  66.75 
 
 
398 aa  548  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5243  tryptophan synthase subunit beta  66.84 
 
 
418 aa  551  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1788  tryptophan synthase subunit beta  68.03 
 
 
435 aa  550  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  68.12 
 
 
393 aa  548  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1215  tryptophan synthase subunit beta  66.75 
 
 
422 aa  550  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0236312 
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  67.98 
 
 
399 aa  545  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  65.28 
 
 
410 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  66.49 
 
 
406 aa  545  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  67.98 
 
 
399 aa  545  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  66.92 
 
 
413 aa  544  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  65.19 
 
 
397 aa  547  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  65.28 
 
 
411 aa  547  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  64.96 
 
 
402 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1771  tryptophan synthase subunit beta  68.46 
 
 
410 aa  546  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  65.15 
 
 
413 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3239  tryptophan synthase subunit beta  66.75 
 
 
422 aa  546  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  65.38 
 
 
417 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  65.9 
 
 
417 aa  542  1e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2592  tryptophan synthase subunit beta  66.5 
 
 
422 aa  543  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4868  tryptophan synthase subunit beta  66.24 
 
 
421 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  65.25 
 
 
409 aa  542  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  64.19 
 
 
402 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.236429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>