More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1216 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20740  tryptophan synthase, beta chain  84.26 
 
 		 415 aa  721    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133254  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1216  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 414 aa  842    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.268288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  78.01 
 
 		 449 aa  625  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1683  tryptophan synthase subunit beta  70.26 
 
 		 442 aa  617  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000190343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1688  tryptophan synthase subunit beta  71.46 
 
 		 443 aa  619  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2220  tryptophan synthase subunit beta  73.04 
 
 		 431 aa  617  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0140  tryptophan synthase subunit beta  73.09 
 
 		 433 aa  612  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1500  tryptophan synthase, beta subunit  74.44 
 
 		 426 aa  608  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1985  tryptophan synthase, beta subunit  75.63 
 
 		 422 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2965  tryptophan synthase subunit beta  72.84 
 
 		 433 aa  595  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0872098  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  73.47 
 
 		 406 aa  597  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5701  tryptophan synthase subunit beta  74.04 
 
 		 411 aa  583  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.194969  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14900  tryptophan synthase subunit beta  71.6 
 
 		 448 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.412247  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1074  tryptophan synthase subunit beta  72.24 
 
 		 425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.32093  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  70.41 
 
 		 420 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  71.36 
 
 		 420 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  71.1 
 
 		 420 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  71.1 
 
 		 420 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1165  tryptophan synthase subunit beta  70.38 
 
 		 412 aa  566  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2947  tryptophan synthase, beta subunit  69.08 
 
 		 455 aa  566  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.378076  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10970  tryptophan synthase subunit beta  66.83 
 
 		 441 aa  565  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0274745  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  69.8 
 
 		 420 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1451  tryptophan synthase subunit beta  71.72 
 
 		 414 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2940  Tryptophan synthase  70.95 
 
 		 414 aa  559  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2874  tryptophan synthase, beta subunit  70.51 
 
 		 424 aa  560  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000102135  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3174  tryptophan synthase, beta subunit  69.31 
 
 		 405 aa  559  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3075  tryptophan synthase subunit beta  70.92 
 
 		 423 aa  557  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000212067  hitchhiker  0.000123729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11628  tryptophan synthase subunit beta  68.97 
 
 		 410 aa  551  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3171  tryptophan synthase subunit beta  68.54 
 
 		 410 aa  547  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3396  tryptophan synthase subunit beta  68.29 
 
 		 410 aa  546  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2054  tryptophan synthase, beta subunit  68.01 
 
 		 443 aa  545  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12890  tryptophan synthase subunit beta  65.76 
 
 		 418 aa  546  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal  0.0360199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3016  tryptophan synthase subunit beta  66.83 
 
 		 445 aa  536  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0445574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5710  tryptophan synthase subunit beta  68.01 
 
 		 440 aa  534  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1932  tryptophan synthase subunit beta  68.73 
 
 		 490 aa  531  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0489987  normal  0.581872 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3026  tryptophan synthase subunit beta  66.92 
 
 		 426 aa  529  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2510  tryptophan synthase subunit beta  65.99 
 
 		 406 aa  525  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  61.52 
 
 		 409 aa  510  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  59.51 
 
 		 414 aa  507  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  61.04 
 
 		 403 aa  504  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  62.08 
 
 		 409 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  59.03 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  59.03 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  59.6 
 
 		 405 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  62.34 
 
 		 418 aa  501  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  62.24 
 
 		 405 aa  498  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  59.75 
 
 		 403 aa  495  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 		 397 aa  495  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  59.5 
 
 		 402 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  60.91 
 
 		 397 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  60.78 
 
 		 410 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  60.8 
 
 		 397 aa  495  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 406 aa  496  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  58.08 
 
 		 409 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 397 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  59.22 
 
 		 393 aa  491  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  61.2 
 
 		 401 aa  491  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 400 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  60.68 
 
 		 407 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  60.94 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  60.94 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4200  tryptophan synthase subunit beta  62.11 
 
 		 434 aa  491  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0203217  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  60.94 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 411 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 405 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 405 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 406 aa  489  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 394 aa  488  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  60.4 
 
 		 404 aa  490  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 409 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 405 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  60.52 
 
 		 401 aa  489  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 391 aa  489  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4057  tryptophan synthase subunit beta  61.6 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  61.3 
 
 		 406 aa  488  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  60.42 
 
 		 409 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  59.39 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  59.17 
 
 		 394 aa  488  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 402 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 406 aa  490  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  60.94 
 
 		 402 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  59.48 
 
 		 434 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  61.2 
 
 		 404 aa  491  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 399 aa  484  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  60.68 
 
 		 405 aa  484  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>