More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28100 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 406 aa  823    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5701  tryptophan synthase subunit beta  79.49 
 
 		 411 aa  647    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.194969  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  73.55 
 
 		 420 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  73.3 
 
 		 420 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  73.3 
 
 		 420 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  72.36 
 
 		 420 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2940  Tryptophan synthase  73.21 
 
 		 414 aa  598  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1451  tryptophan synthase subunit beta  73.72 
 
 		 414 aa  597  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1216  tryptophan synthase subunit beta  73.47 
 
 		 414 aa  597  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.268288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  71.86 
 
 		 420 aa  591  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2947  tryptophan synthase, beta subunit  73.12 
 
 		 455 aa  590  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.378076  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11628  tryptophan synthase subunit beta  71.43 
 
 		 410 aa  589  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1165  tryptophan synthase subunit beta  72.45 
 
 		 412 aa  586  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  74.68 
 
 		 449 aa  585  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2054  tryptophan synthase, beta subunit  70.57 
 
 		 443 aa  581  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20740  tryptophan synthase, beta chain  72.38 
 
 		 415 aa  581  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133254  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1683  tryptophan synthase subunit beta  69.52 
 
 		 442 aa  577  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000190343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3174  tryptophan synthase, beta subunit  71.5 
 
 		 405 aa  579  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1688  tryptophan synthase subunit beta  70.53 
 
 		 443 aa  580  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2220  tryptophan synthase subunit beta  72.68 
 
 		 431 aa  578  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2874  tryptophan synthase, beta subunit  73.32 
 
 		 424 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000102135  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2965  tryptophan synthase subunit beta  72.26 
 
 		 433 aa  577  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0872098  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1074  tryptophan synthase subunit beta  71.87 
 
 		 425 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.32093  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14900  tryptophan synthase subunit beta  74.87 
 
 		 448 aa  567  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.412247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3075  tryptophan synthase subunit beta  70.53 
 
 		 423 aa  564  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000212067  hitchhiker  0.000123729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1985  tryptophan synthase, beta subunit  73.1 
 
 		 422 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1500  tryptophan synthase, beta subunit  73.16 
 
 		 426 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0140  tryptophan synthase subunit beta  69.37 
 
 		 433 aa  560  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10970  tryptophan synthase subunit beta  69.27 
 
 		 441 aa  556  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0274745  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1932  tryptophan synthase subunit beta  70.18 
 
 		 490 aa  551  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0489987  normal  0.581872 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12890  tryptophan synthase subunit beta  69.41 
 
 		 418 aa  548  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal  0.0360199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3171  tryptophan synthase subunit beta  67.83 
 
 		 410 aa  545  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3396  tryptophan synthase subunit beta  66.99 
 
 		 410 aa  545  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3016  tryptophan synthase subunit beta  68.53 
 
 		 445 aa  542  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0445574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2510  tryptophan synthase subunit beta  66.08 
 
 		 406 aa  529  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  65.1 
 
 		 409 aa  525  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  62.95 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  62.95 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  62.95 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  64.6 
 
 		 409 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  64.25 
 
 		 405 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5710  tryptophan synthase subunit beta  68.26 
 
 		 440 aa  517  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  65.38 
 
 		 401 aa  515  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  65.8 
 
 		 394 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0215  tryptophan synthase subunit beta  64.68 
 
 		 391 aa  513  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 397 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 397 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4057  tryptophan synthase subunit beta  63.04 
 
 		 431 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4200  tryptophan synthase subunit beta  64.43 
 
 		 434 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0203217  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 397 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 397 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3026  tryptophan synthase subunit beta  64.46 
 
 		 426 aa  511  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  61 
 
 		 406 aa  510  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  62.18 
 
 		 402 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  63.82 
 
 		 394 aa  510  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4173  tryptophan synthase subunit beta  62.78 
 
 		 432 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  62.53 
 
 		 403 aa  511  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  61.25 
 
 		 406 aa  511  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  60.75 
 
 		 422 aa  509  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  61.92 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  62.94 
 
 		 413 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  64.58 
 
 		 399 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  62.02 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  62.79 
 
 		 400 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  63.47 
 
 		 407 aa  508  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  64.16 
 
 		 394 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  62.27 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  63.73 
 
 		 411 aa  505  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  63.82 
 
 		 418 aa  507  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  61.82 
 
 		 414 aa  507  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 413 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  61.14 
 
 		 415 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  63.96 
 
 		 402 aa  502  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  62.57 
 
 		 406 aa  502  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  61.18 
 
 		 405 aa  501  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  62.95 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  64.25 
 
 		 402 aa  501  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  62.79 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  60.75 
 
 		 406 aa  504  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  64.66 
 
 		 404 aa  503  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 403 aa  501  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  61.7 
 
 		 411 aa  500  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  62.53 
 
 		 399 aa  499  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  61.93 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3585  tryptophan synthase subunit beta  61.89 
 
 		 409 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  61.92 
 
 		 397 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 399 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  61.77 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  61.92 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 405 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  64.08 
 
 		 395 aa  498  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3270  tryptophan synthase subunit beta  61.89 
 
 		 409 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.244666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>