More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_01931 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  79.42 
 
 		 417 aa  690    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27051  tryptophan synthase subunit beta  77.18 
 
 		 421 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01841  tryptophan synthase subunit beta  92.75 
 
 		 414 aa  795    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  79.18 
 
 		 417 aa  689    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2098  tryptophan synthase subunit beta  77.05 
 
 		 418 aa  680    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2418  tryptophan synthase subunit beta  79.95 
 
 		 418 aa  660    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0166  tryptophan synthase subunit beta  92.51 
 
 		 414 aa  795    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0594261  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  77.18 
 
 		 416 aa  682    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01931  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 414 aa  858    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  93 
 
 		 414 aa  793    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  74.11 
 
 		 413 aa  610  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  72.86 
 
 		 413 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  72.8 
 
 		 420 aa  598  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  71.14 
 
 		 409 aa  598  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  72.84 
 
 		 413 aa  597  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  70.3 
 
 		 411 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  72.34 
 
 		 413 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  72.34 
 
 		 413 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  72.15 
 
 		 415 aa  588  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  68.92 
 
 		 417 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  65.3 
 
 		 409 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  64.05 
 
 		 397 aa  537  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  63.71 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  63.71 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  63.71 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  64.3 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  63.96 
 
 		 397 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  63.71 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  63.57 
 
 		 397 aa  537  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  64.05 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  64.57 
 
 		 399 aa  532  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  63.54 
 
 		 397 aa  532  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  64.57 
 
 		 399 aa  532  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  62.78 
 
 		 409 aa  531  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  63.82 
 
 		 399 aa  527  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  63.43 
 
 		 391 aa  523  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 		 396 aa  519  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 399 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  62.85 
 
 		 401 aa  515  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4976  tryptophan synthase subunit beta  62.09 
 
 		 410 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 399 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  64.25 
 
 		 393 aa  515  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  59.32 
 
 		 411 aa  511  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 396 aa  512  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  62.09 
 
 		 406 aa  511  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0143  tryptophan synthase subunit beta  61.39 
 
 		 405 aa  510  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  60.64 
 
 		 404 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  62.15 
 
 		 404 aa  509  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  62.12 
 
 		 401 aa  511  1e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  59.55 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  60.35 
 
 		 409 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  59.61 
 
 		 418 aa  507  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1321  tryptophan synthase subunit beta  63.83 
 
 		 373 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000135158 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  61.52 
 
 		 399 aa  508  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  60.55 
 
 		 396 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 404 aa  506  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 403 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 402 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  61.32 
 
 		 402 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 403 aa  502  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  63.01 
 
 		 395 aa  503  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  60.3 
 
 		 410 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  60.55 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  60.9 
 
 		 408 aa  502  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  60.65 
 
 		 405 aa  502  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1031  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 410 aa  504  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.466116  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  59.65 
 
 		 404 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  62.69 
 
 		 402 aa  504  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 412 aa  503  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  59.16 
 
 		 404 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  61.03 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 		 397 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  58.06 
 
 		 406 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  60.91 
 
 		 400 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 414 aa  499  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  60.25 
 
 		 407 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  60.35 
 
 		 410 aa  499  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  58.21 
 
 		 410 aa  499  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 		 402 aa  501  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 434 aa  499  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  59 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 405 aa  497  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 397 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 398 aa  494  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  59.75 
 
 		 409 aa  497  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 397 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 397 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  59 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 406 aa  498  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>