More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1120 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 389 aa  786    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  69.27 
 
 		 394 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  68.75 
 
 		 394 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  67.97 
 
 		 394 aa  566  1e-160  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  68.23 
 
 		 394 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  64.75 
 
 		 391 aa  526  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  65.89 
 
 		 414 aa  524  1e-148  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  64.74 
 
 		 404 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  62.92 
 
 		 394 aa  512  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  62.2 
 
 		 396 aa  511  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  62.01 
 
 		 397 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  63.52 
 
 		 409 aa  508  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  63.16 
 
 		 409 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  60.63 
 
 		 396 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3622  tryptophan synthase subunit beta  62.02 
 
 		 426 aa  501  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  62.04 
 
 		 409 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  65.18 
 
 		 393 aa  501  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  61.58 
 
 		 411 aa  503  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0076  tryptophan synthase subunit beta  60.84 
 
 		 390 aa  498  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  60.42 
 
 		 405 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  62.24 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003084  tryptophan synthase beta chain  60 
 
 		 396 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  61.62 
 
 		 408 aa  498  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  62.5 
 
 		 397 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  62.24 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  62.5 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  62.83 
 
 		 406 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2876  tryptophan synthase subunit beta  61.21 
 
 		 414 aa  501  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 		 405 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  60.84 
 
 		 409 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  61.72 
 
 		 397 aa  494  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  61.72 
 
 		 397 aa  494  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  61.98 
 
 		 397 aa  495  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  60.42 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.72 
 
 		 397 aa  494  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  60.95 
 
 		 396 aa  497  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 		 405 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02762  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 396 aa  497  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 394 aa  495  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  61.48 
 
 		 396 aa  497  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 		 398 aa  496  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  62.27 
 
 		 399 aa  497  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  60.42 
 
 		 401 aa  494  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  60.95 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  60.68 
 
 		 411 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  62.24 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  61.74 
 
 		 399 aa  491  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  59.63 
 
 		 399 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  62.04 
 
 		 406 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  59.63 
 
 		 399 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 		 409 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1415  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 425 aa  491  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  61.74 
 
 		 399 aa  492  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  60.68 
 
 		 401 aa  493  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2237  tryptophan synthase subunit beta  60.68 
 
 		 440 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  61.78 
 
 		 422 aa  491  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0108  tryptophan synthase subunit beta  61.76 
 
 		 393 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  61.94 
 
 		 410 aa  491  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  60.16 
 
 		 402 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1176  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 395 aa  492  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.833361  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  61.5 
 
 		 406 aa  492  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0223  tryptophan synthase subunit beta  61.54 
 
 		 388 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  59.53 
 
 		 405 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 415 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 406 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  61.74 
 
 		 399 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  61.74 
 
 		 399 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  60.42 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  62.37 
 
 		 406 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  60.42 
 
 		 397 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 413 aa  489  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 413 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  62.04 
 
 		 406 aa  488  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  61.32 
 
 		 403 aa  488  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  61.48 
 
 		 395 aa  491  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 402 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 413 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  59.89 
 
 		 406 aa  489  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2671  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 396 aa  484  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000253614 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0942  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 		 402 aa  487  1e-136  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  60.42 
 
 		 397 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  60.42 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  59.89 
 
 		 394 aa  484  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 410 aa  485  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01841  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 414 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  60.79 
 
 		 415 aa  487  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2316  tryptophan synthase subunit beta  61.04 
 
 		 396 aa  487  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  60.16 
 
 		 403 aa  486  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2046  tryptophan synthase subunit beta  61.04 
 
 		 396 aa  487  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 400 aa  485  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  60.42 
 
 		 397 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  59.89 
 
 		 403 aa  487  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  60.16 
 
 		 397 aa  484  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2321  tryptophan synthase subunit beta  61.04 
 
 		 396 aa  487  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  60.16 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  59.89 
 
 		 394 aa  486  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>