More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2237 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2237  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 440 aa  894    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0079  tryptophan synthase subunit beta  83.25 
 
 		 382 aa  662    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  77.44 
 
 		 402 aa  656    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2876  tryptophan synthase subunit beta  83.33 
 
 		 414 aa  707    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0798  tryptophan synthase subunit beta  71.87 
 
 		 400 aa  590  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0583  tryptophan synthase subunit beta  70.5 
 
 		 403 aa  579  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  64.14 
 
 		 398 aa  518  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  62.98 
 
 		 391 aa  511  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1361  tryptophan synthase subunit beta  63.21 
 
 		 391 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.059714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  62.53 
 
 		 397 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  62.31 
 
 		 409 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  61.48 
 
 		 401 aa  498  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  61.44 
 
 		 405 aa  495  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  60.68 
 
 		 389 aa  497  1e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  62.34 
 
 		 396 aa  495  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1440  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 386 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000281264  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  60.78 
 
 		 409 aa  496  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  62.27 
 
 		 396 aa  495  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 		 394 aa  498  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  61.22 
 
 		 395 aa  493  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  61.82 
 
 		 404 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 396 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2939  tryptophan synthase subunit beta  62.53 
 
 		 387 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  58.57 
 
 		 414 aa  491  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0720  tryptophan synthase subunit beta  61.68 
 
 		 391 aa  488  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0709059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  62.23 
 
 		 393 aa  490  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  60.15 
 
 		 402 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 		 399 aa  484  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 		 399 aa  485  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  60.93 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  59.03 
 
 		 406 aa  487  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  59.7 
 
 		 412 aa  487  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 411 aa  488  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 		 399 aa  484  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 396 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  60.63 
 
 		 394 aa  483  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 396 aa  484  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 394 aa  484  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 411 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  60.67 
 
 		 402 aa  481  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  59.08 
 
 		 401 aa  482  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  61.7 
 
 		 399 aa  481  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 402 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 403 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  58.96 
 
 		 406 aa  478  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  57.92 
 
 		 399 aa  478  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  57.92 
 
 		 399 aa  478  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  60.26 
 
 		 449 aa  480  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  59.43 
 
 		 397 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 401 aa  479  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  58.35 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  58.44 
 
 		 428 aa  481  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 394 aa  478  1e-134  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  58.46 
 
 		 403 aa  480  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  58.31 
 
 		 405 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 410 aa  480  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 394 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  58.57 
 
 		 405 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  59.17 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  61.04 
 
 		 409 aa  477  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  57.84 
 
 		 406 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  58.91 
 
 		 397 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  60.52 
 
 		 394 aa  477  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  59.17 
 
 		 397 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 407 aa  478  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  59.17 
 
 		 397 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  59.43 
 
 		 397 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  57.99 
 
 		 403 aa  478  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  59.17 
 
 		 397 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  58.57 
 
 		 405 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  56.75 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  60.21 
 
 		 404 aa  473  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  58.75 
 
 		 399 aa  474  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  57.58 
 
 		 406 aa  472  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  56.3 
 
 		 422 aa  473  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  57.62 
 
 		 394 aa  474  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  58.91 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  60.78 
 
 		 404 aa  473  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  58.93 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  58.57 
 
 		 405 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  57.36 
 
 		 394 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 413 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  60.73 
 
 		 406 aa  474  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  59.17 
 
 		 397 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  58.4 
 
 		 411 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  57.04 
 
 		 406 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  58.75 
 
 		 399 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  58.18 
 
 		 402 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  58.52 
 
 		 405 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  59.38 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  58.93 
 
 		 404 aa  472  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1415  tryptophan synthase subunit beta  55.75 
 
 		 425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  58.91 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  58.91 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0215  tryptophan synthase subunit beta  60.52 
 
 		 391 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>