More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1176 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1176  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 395 aa  808    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.833361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  70.92 
 
 		 394 aa  590  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3843  tryptophan synthase subunit beta  68.19 
 
 		 394 aa  566  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  69.13 
 
 		 394 aa  564  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2128  tryptophan synthase, beta subunit  65.13 
 
 		 394 aa  550  1e-155  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 391 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1349  tryptophan synthase, beta subunit  62.63 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106047 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  58.61 
 
 		 409 aa  497  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  59.42 
 
 		 409 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  58.42 
 
 		 412 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 389 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 409 aa  491  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  57.58 
 
 		 399 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  57.58 
 
 		 399 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 401 aa  488  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  57.59 
 
 		 399 aa  488  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  57.95 
 
 		 406 aa  487  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  58.96 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  58.21 
 
 		 406 aa  487  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  57.69 
 
 		 422 aa  485  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  56.15 
 
 		 402 aa  484  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 402 aa  485  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  58.18 
 
 		 394 aa  484  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  56.52 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  58.7 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  57.11 
 
 		 405 aa  484  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  58.96 
 
 		 397 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  58.7 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  58.7 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  58.44 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  58.7 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  58.7 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  57.92 
 
 		 394 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  56.81 
 
 		 396 aa  481  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 394 aa  480  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  57.92 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  56.81 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  57.8 
 
 		 401 aa  477  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 393 aa  475  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  56.81 
 
 		 396 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  57.14 
 
 		 447 aa  475  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 396 aa  477  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  56.67 
 
 		 407 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  58.18 
 
 		 394 aa  478  1e-133  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  56.81 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 		 420 aa  474  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1688  tryptophan synthase subunit beta  58.02 
 
 		 443 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  58.7 
 
 		 406 aa  474  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  60.47 
 
 		 402 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1683  tryptophan synthase subunit beta  57.25 
 
 		 442 aa  477  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000190343 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  56.56 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  56.56 
 
 		 406 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  55.5 
 
 		 428 aa  473  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 397 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3174  tryptophan synthase, beta subunit  58.14 
 
 		 405 aa  472  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  55.75 
 
 		 396 aa  474  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  56.67 
 
 		 397 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  57.84 
 
 		 408 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  58.07 
 
 		 401 aa  473  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  57.22 
 
 		 397 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 420 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  55.64 
 
 		 403 aa  472  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  57.11 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  56.67 
 
 		 397 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  56.15 
 
 		 406 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  57.36 
 
 		 397 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  56.67 
 
 		 397 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  56.7 
 
 		 397 aa  471  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 420 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  54.62 
 
 		 406 aa  471  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  56.63 
 
 		 434 aa  472  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  55.78 
 
 		 399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  55.78 
 
 		 399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  56.19 
 
 		 406 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1440  tryptophan synthase subunit beta  59.53 
 
 		 386 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000281264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  55.64 
 
 		 404 aa  470  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  56.7 
 
 		 397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 420 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  56.67 
 
 		 397 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  57.14 
 
 		 394 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10970  tryptophan synthase subunit beta  55.78 
 
 		 441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0274745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 420 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 397 aa  465  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  55.78 
 
 		 406 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  53.57 
 
 		 399 aa  465  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  56.62 
 
 		 411 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  54.62 
 
 		 405 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  57.85 
 
 		 398 aa  465  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  56.81 
 
 		 418 aa  464  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  56.7 
 
 		 397 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  55.27 
 
 		 406 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  56.28 
 
 		 414 aa  468  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>