More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0076 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0076  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 390 aa  785    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0223  tryptophan synthase subunit beta  71.39 
 
 		 388 aa  568  1e-161  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1394  tryptophan synthase subunit beta  69.25 
 
 		 392 aa  560  1e-158  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000239329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1790  tryptophan synthase subunit beta  68.07 
 
 		 391 aa  531  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0215  tryptophan synthase subunit beta  67.01 
 
 		 391 aa  532  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 		 394 aa  511  1e-144  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  62.02 
 
 		 391 aa  514  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  61.2 
 
 		 394 aa  509  1e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  65.88 
 
 		 409 aa  509  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 394 aa  502  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  60.68 
 
 		 394 aa  504  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  60.84 
 
 		 389 aa  498  1e-140  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  61.18 
 
 		 394 aa  498  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 414 aa  498  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  65.04 
 
 		 401 aa  497  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  60.84 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  62.95 
 
 		 409 aa  491  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3622  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 426 aa  490  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 		 397 aa  491  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  65.18 
 
 		 394 aa  485  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  61.94 
 
 		 399 aa  483  1e-135  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0108  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 393 aa  484  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  58.87 
 
 		 394 aa  481  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 		 397 aa  481  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0915  tryptophan synthase subunit beta  61.98 
 
 		 395 aa  481  1e-135  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4173  tryptophan synthase subunit beta  62.24 
 
 		 432 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  62.89 
 
 		 395 aa  478  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4200  tryptophan synthase subunit beta  62.5 
 
 		 434 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0203217  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 389 aa  478  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4057  tryptophan synthase subunit beta  62.5 
 
 		 431 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  60.52 
 
 		 418 aa  480  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  65.08 
 
 		 406 aa  478  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 389 aa  478  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  61.6 
 
 		 405 aa  478  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  58.4 
 
 		 398 aa  478  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  60.47 
 
 		 393 aa  477  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  63.73 
 
 		 404 aa  476  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 396 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3843  tryptophan synthase subunit beta  58.87 
 
 		 394 aa  473  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  60.72 
 
 		 412 aa  474  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  62.63 
 
 		 402 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  60.21 
 
 		 396 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  59.07 
 
 		 406 aa  471  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 403 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0839  tryptophan synthase, beta subunit  57.7 
 
 		 401 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  60.26 
 
 		 399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  60.1 
 
 		 671 aa  469  1.0000000000000001e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  58.29 
 
 		 403 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  61.08 
 
 		 404 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1586  tryptophan synthase subunit beta  60.37 
 
 		 409 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 403 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1433  tryptophan synthase subunit beta  57.37 
 
 		 404 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  60.47 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 399 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2705  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 396 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  60.36 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3023  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 396 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2407  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  58.55 
 
 		 399 aa  465  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  58.55 
 
 		 399 aa  465  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 413 aa  466  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2726  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.93556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  59.02 
 
 		 396 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 399 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  59.07 
 
 		 408 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 397 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2454  tryptophan synthase subunit beta  59.84 
 
 		 401 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 410 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1462  tryptophan synthase subunit beta  57.37 
 
 		 404 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  57.77 
 
 		 404 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1425  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 403 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  60.62 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1660  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014764 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 422 aa  464  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2805  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 396 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  58.76 
 
 		 434 aa  464  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  59.84 
 
 		 406 aa  468  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  59.84 
 
 		 397 aa  461  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  59.02 
 
 		 399 aa  461  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 400 aa  464  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1321  tryptophan synthase subunit beta  59.84 
 
 		 373 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000135158 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  59.84 
 
 		 407 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 403 aa  464  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0193  tryptophan synthase subunit beta  61.78 
 
 		 394 aa  462  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1771  tryptophan synthase subunit beta  60.63 
 
 		 410 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1516  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 396 aa  464  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>