More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0915 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0915  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 395 aa  808    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  62.85 
 
 		 414 aa  536  1e-151  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  62.76 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  65.01 
 
 		 409 aa  525  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  61.73 
 
 		 396 aa  521  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  64.77 
 
 		 391 aa  524  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  61.6 
 
 		 397 aa  519  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  61.48 
 
 		 397 aa  512  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  61.5 
 
 		 394 aa  513  1e-144  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  61.89 
 
 		 399 aa  512  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  61.22 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  61.22 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  61.22 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  61.24 
 
 		 394 aa  510  1e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 		 394 aa  508  1e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.22 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  60.5 
 
 		 417 aa  510  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  61.48 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  62.53 
 
 		 401 aa  508  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  61.48 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  61.98 
 
 		 389 aa  509  1e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  60.72 
 
 		 394 aa  509  1e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  62.24 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  64.23 
 
 		 395 aa  504  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  60.97 
 
 		 397 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 397 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  62.14 
 
 		 394 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  62.24 
 
 		 399 aa  505  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  65.16 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  61.95 
 
 		 398 aa  504  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 434 aa  501  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0076  tryptophan synthase subunit beta  61.98 
 
 		 390 aa  504  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0223  tryptophan synthase subunit beta  62.01 
 
 		 388 aa  502  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  61.34 
 
 		 397 aa  501  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  60.82 
 
 		 406 aa  496  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  62.5 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 413 aa  494  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 413 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  58.79 
 
 		 415 aa  491  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 396 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  61.15 
 
 		 397 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  61.2 
 
 		 412 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  60.47 
 
 		 396 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  61.68 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  61.42 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0215  tryptophan synthase subunit beta  60.21 
 
 		 391 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  61.42 
 
 		 397 aa  491  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  61.42 
 
 		 397 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 396 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  61.42 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  61.26 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  61.26 
 
 		 397 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 411 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  61.42 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  59.95 
 
 		 402 aa  489  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  61.42 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  59.69 
 
 		 409 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  61.42 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  61.15 
 
 		 399 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  61.15 
 
 		 399 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  59.85 
 
 		 671 aa  491  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 399 aa  491  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 413 aa  489  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  61.42 
 
 		 397 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  61.42 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  60.37 
 
 		 399 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  60.37 
 
 		 399 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  61.68 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3239  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 422 aa  488  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 		 402 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  60.89 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  61.42 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 		 389 aa  489  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 		 389 aa  489  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  61.42 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 		 397 aa  484  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  60.21 
 
 		 403 aa  486  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 406 aa  486  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  58.66 
 
 		 409 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3622  tryptophan synthase subunit beta  60.78 
 
 		 426 aa  486  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  59.06 
 
 		 402 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 405 aa  485  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  58.57 
 
 		 394 aa  488  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5243  tryptophan synthase subunit beta  57.39 
 
 		 418 aa  485  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1119  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 399 aa  487  1e-136  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00584813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1321  tryptophan synthase subunit beta  61.89 
 
 		 373 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000135158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  58.4 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  59.03 
 
 		 447 aa  485  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0108  tryptophan synthase subunit beta  59.48 
 
 		 393 aa  487  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 409 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 404 aa  484  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1394  tryptophan synthase subunit beta  59.53 
 
 		 392 aa  485  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000239329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0839  tryptophan synthase, beta subunit  59.59 
 
 		 401 aa  485  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 409 aa  485  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 405 aa  484  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 428 aa  485  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 406 aa  487  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  58.55 
 
 		 410 aa  481  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  58.06 
 
 		 405 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>