More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1119 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1119  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 399 aa  828    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00584813  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0839  tryptophan synthase, beta subunit  79 
 
 		 401 aa  664    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  65.3 
 
 		 391 aa  531  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  64.51 
 
 		 396 aa  509  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  63.99 
 
 		 396 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  63.02 
 
 		 396 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  63.8 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  64.47 
 
 		 396 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 		 404 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0063  tryptophan synthase subunit beta  60.93 
 
 		 414 aa  504  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 		 405 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0097  tryptophan synthase subunit beta  61.21 
 
 		 407 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 		 409 aa  498  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  61.32 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  61.01 
 
 		 405 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  63.28 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  60.86 
 
 		 406 aa  494  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 410 aa  497  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  61.27 
 
 		 405 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  61.01 
 
 		 405 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  62.7 
 
 		 406 aa  494  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  62.34 
 
 		 424 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0055  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 414 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.660106  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  61.01 
 
 		 405 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  59.08 
 
 		 414 aa  491  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  61.89 
 
 		 409 aa  493  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 		 415 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  62.08 
 
 		 424 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 406 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 		 404 aa  491  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  60.26 
 
 		 409 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  61.72 
 
 		 409 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  62.5 
 
 		 409 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 		 401 aa  491  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0206  tryptophan synthase subunit beta  61.32 
 
 		 419 aa  491  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  61.79 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  59.07 
 
 		 394 aa  486  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  59.23 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  62.7 
 
 		 405 aa  487  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  60.94 
 
 		 389 aa  486  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  63.06 
 
 		 410 aa  484  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  60.76 
 
 		 401 aa  488  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 397 aa  487  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  61.03 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  62.3 
 
 		 404 aa  485  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  61.03 
 
 		 404 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  61.21 
 
 		 396 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  57.89 
 
 		 410 aa  485  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  60.94 
 
 		 389 aa  486  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1031  tryptophan synthase subunit beta  60.87 
 
 		 410 aa  487  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.466116  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1872  tryptophan synthase subunit beta  58.06 
 
 		 413 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0911585 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0201  tryptophan synthase subunit beta  58.06 
 
 		 413 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  58.75 
 
 		 413 aa  483  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  59.07 
 
 		 394 aa  482  1e-135  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.3 
 
 		 409 aa  483  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  58.55 
 
 		 394 aa  483  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 410 aa  482  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0176  tryptophan synthase subunit beta  57.82 
 
 		 430 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3887  tryptophan synthase subunit beta  60.56 
 
 		 410 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.85731 
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  58.9 
 
 		 406 aa  481  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  62.17 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  62.17 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  58.65 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  61.64 
 
 		 411 aa  478  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 402 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  59 
 
 		 408 aa  481  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  61.32 
 
 		 406 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 404 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  59.63 
 
 		 411 aa  478  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0147  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  59.64 
 
 		 417 aa  480  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0118  tryptophan synthase subunit beta  57.57 
 
 		 413 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 399 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3585  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 409 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  61.95 
 
 		 395 aa  478  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  61.32 
 
 		 403 aa  477  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  57.5 
 
 		 406 aa  475  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  58.55 
 
 		 394 aa  477  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 399 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3270  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 409 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.244666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  61.64 
 
 		 402 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  57.89 
 
 		 406 aa  474  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  61.64 
 
 		 402 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1691  tryptophan synthase subunit beta  59.52 
 
 		 393 aa  473  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  60.79 
 
 		 393 aa  473  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1990  tryptophan synthase subunit beta  59.45 
 
 		 414 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 406 aa  473  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  58.02 
 
 		 409 aa  471  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  56.81 
 
 		 411 aa  473  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  60.42 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  60 
 
 		 402 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>