More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0215 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0215  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 391 aa  800    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1394  tryptophan synthase subunit beta  67.27 
 
 		 392 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000239329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0076  tryptophan synthase subunit beta  67.01 
 
 		 390 aa  532  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1790  tryptophan synthase subunit beta  66.32 
 
 		 391 aa  526  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  64.49 
 
 		 409 aa  518  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0223  tryptophan synthase subunit beta  65.35 
 
 		 388 aa  514  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  64.68 
 
 		 406 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4057  tryptophan synthase subunit beta  63.21 
 
 		 431 aa  501  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 403 aa  501  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4200  tryptophan synthase subunit beta  63.47 
 
 		 434 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0203217  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  62.63 
 
 		 395 aa  498  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 418 aa  498  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4173  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 432 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  61.03 
 
 		 404 aa  494  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.03 
 
 		 409 aa  495  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 391 aa  494  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  61.79 
 
 		 413 aa  494  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2688  tryptophan synthase subunit beta  61.44 
 
 		 408 aa  493  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 411 aa  491  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  60.93 
 
 		 399 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 413 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  59.06 
 
 		 394 aa  490  1e-137  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 414 aa  489  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  61.84 
 
 		 405 aa  488  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2833  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 395 aa  488  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  60.93 
 
 		 409 aa  488  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  58.01 
 
 		 394 aa  486  1e-136  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 399 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 399 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3191  tryptophan synthase, beta subunit  58.14 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 413 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 394 aa  487  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  58.93 
 
 		 394 aa  487  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 398 aa  487  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  59.08 
 
 		 406 aa  485  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  58.79 
 
 		 394 aa  488  1e-136  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 396 aa  484  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 399 aa  484  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  60.93 
 
 		 399 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3526  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 420 aa  482  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  59.64 
 
 		 402 aa  483  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 415 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  60.93 
 
 		 399 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 396 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  58.46 
 
 		 401 aa  482  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02292  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 393 aa  481  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0371  tryptophan synthase subunit beta  63.52 
 
 		 426 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.197532 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  61.56 
 
 		 402 aa  482  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 410 aa  481  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3701  tryptophan synthase subunit beta  61.95 
 
 		 396 aa  483  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142022 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  58.49 
 
 		 401 aa  483  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  58.89 
 
 		 389 aa  483  1e-135  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 399 aa  484  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  57.95 
 
 		 671 aa  478  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 413 aa  480  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5701  tryptophan synthase subunit beta  61.84 
 
 		 411 aa  480  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.194969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  58.96 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  58.96 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  58.31 
 
 		 406 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  58.96 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  58.96 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  58.06 
 
 		 406 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  58.06 
 
 		 406 aa  478  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 404 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  61.24 
 
 		 406 aa  478  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  60.52 
 
 		 406 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  58.42 
 
 		 394 aa  479  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 410 aa  478  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  60.31 
 
 		 449 aa  479  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 404 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 405 aa  476  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  58.44 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  58.31 
 
 		 406 aa  476  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  58.7 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  58.31 
 
 		 422 aa  476  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  58.82 
 
 		 409 aa  475  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1451  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 414 aa  475  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 396 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  58.31 
 
 		 404 aa  475  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  58.44 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 411 aa  476  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3843  tryptophan synthase subunit beta  57.91 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  57.22 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  58.7 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  59.08 
 
 		 406 aa  474  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3622  tryptophan synthase subunit beta  57.87 
 
 		 426 aa  471  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  60.21 
 
 		 410 aa  474  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  58.18 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  59.08 
 
 		 406 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 		 406 aa  472  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1261  tryptophan synthase subunit beta  57.8 
 
 		 404 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  57.84 
 
 		 424 aa  473  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  59.17 
 
 		 411 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  59.84 
 
 		 411 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  58.63 
 
 		 399 aa  472  1e-132  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1074  tryptophan synthase subunit beta  60.72 
 
 		 425 aa  471  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.32093  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  58.61 
 
 		 406 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>