More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0776 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0673  tryptophan synthase subunit beta  79.7 
 
 		 400 aa  680    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355692 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0535  tryptophan synthase subunit beta  76.19 
 
 		 399 aa  640    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000244592  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1297  tryptophan synthase subunit beta  77.44 
 
 		 399 aa  644    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.311384  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0776  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 400 aa  828    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0491  tryptophan synthase subunit beta  81.45 
 
 		 399 aa  673    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0827  tryptophan synthase subunit beta  79.95 
 
 		 399 aa  665    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1943  tryptophan synthase subunit beta  77.16 
 
 		 399 aa  638    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.233821  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  66.58 
 
 		 402 aa  534  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  64.6 
 
 		 409 aa  531  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  63.47 
 
 		 399 aa  504  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  63.47 
 
 		 399 aa  504  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  61.58 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  61.19 
 
 		 417 aa  507  9.999999999999999e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  62.15 
 
 		 403 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  61.58 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  61.58 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  61.83 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  61.58 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  61.58 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  61.58 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  61.83 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  62.24 
 
 		 406 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 		 404 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  61.58 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  61.83 
 
 		 397 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  61.58 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  61.58 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  62.82 
 
 		 405 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 404 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  61.79 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  62.82 
 
 		 398 aa  500  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  61.79 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  62.3 
 
 		 399 aa  499  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  60.45 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  61.75 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  59.7 
 
 		 397 aa  495  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 404 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  61.73 
 
 		 447 aa  495  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  60.95 
 
 		 406 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  60.97 
 
 		 406 aa  495  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  61.75 
 
 		 417 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  61.92 
 
 		 394 aa  494  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  60.93 
 
 		 399 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 405 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 397 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  61.14 
 
 		 410 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  61.48 
 
 		 409 aa  491  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01270  tryptophan synthase subunit beta  61.22 
 
 		 405 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  60.3 
 
 		 404 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  59.45 
 
 		 403 aa  491  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  60.56 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  60.56 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  59.7 
 
 		 407 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  61.62 
 
 		 402 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0097  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 407 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  60.93 
 
 		 399 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  60.47 
 
 		 391 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  61.03 
 
 		 397 aa  491  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  59.39 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  60.25 
 
 		 411 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  60.45 
 
 		 413 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1872  tryptophan synthase subunit beta  59.65 
 
 		 413 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0911585 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  61.6 
 
 		 401 aa  490  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  59.75 
 
 		 404 aa  491  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27051  tryptophan synthase subunit beta  62.41 
 
 		 421 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  58.78 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0063  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 414 aa  491  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  61.58 
 
 		 402 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1024  tryptophan synthase subunit beta  61.29 
 
 		 414 aa  488  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204551  hitchhiker  0.00011605 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 410 aa  491  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  59.8 
 
 		 397 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 412 aa  488  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  60.45 
 
 		 413 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 434 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  59.14 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  59.14 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  59.14 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  61.18 
 
 		 405 aa  487  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 409 aa  484  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 401 aa  488  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  59.14 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  59.19 
 
 		 408 aa  485  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5243  tryptophan synthase subunit beta  60.56 
 
 		 418 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  58.4 
 
 		 409 aa  486  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  59.14 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  59.39 
 
 		 397 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1031  tryptophan synthase subunit beta  58.4 
 
 		 410 aa  487  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.466116  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  61.36 
 
 		 409 aa  486  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  59.8 
 
 		 415 aa  486  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 405 aa  487  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 411 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1415  tryptophan synthase subunit beta  59.35 
 
 		 425 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  59.34 
 
 		 428 aa  484  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  59.1 
 
 		 410 aa  488  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 414 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>