More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1024 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1024  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 414 aa  836    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204551  hitchhiker  0.00011605 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  73.88 
 
 		 417 aa  620  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  73.88 
 
 		 406 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  64.36 
 
 		 409 aa  528  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  64.14 
 
 		 410 aa  528  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  64.29 
 
 		 391 aa  522  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  66.84 
 
 		 409 aa  521  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  65.36 
 
 		 410 aa  521  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  61.81 
 
 		 401 aa  519  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  62.13 
 
 		 414 aa  518  1e-146  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  63.61 
 
 		 411 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  65.13 
 
 		 396 aa  514  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  62.34 
 
 		 409 aa  511  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  63.57 
 
 		 413 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  64.38 
 
 		 405 aa  512  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  63.36 
 
 		 405 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  64.38 
 
 		 404 aa  512  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  62.66 
 
 		 403 aa  514  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  63.89 
 
 		 407 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 		 402 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  64.01 
 
 		 397 aa  514  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 411 aa  513  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 405 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  62.32 
 
 		 403 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  60.8 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  60.8 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  61.06 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  60.8 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  63.2 
 
 		 410 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  62.81 
 
 		 402 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  65.32 
 
 		 404 aa  508  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  64.27 
 
 		 396 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  60.8 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  63.07 
 
 		 408 aa  511  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 405 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  62.34 
 
 		 405 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  62.88 
 
 		 406 aa  509  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  62.91 
 
 		 402 aa  509  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  64.03 
 
 		 411 aa  509  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  64.54 
 
 		 409 aa  508  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 402 aa  508  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  60.8 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  60.3 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  63.29 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  62.09 
 
 		 409 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  60.91 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  63.52 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  62.35 
 
 		 413 aa  505  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  60.3 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  60.55 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  62.98 
 
 		 402 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  63.52 
 
 		 397 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  64.01 
 
 		 393 aa  504  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  63.01 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  62.59 
 
 		 449 aa  504  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  62.81 
 
 		 413 aa  507  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  63.8 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  64.1 
 
 		 394 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0776  tryptophan synthase subunit beta  61.29 
 
 		 400 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  61.39 
 
 		 417 aa  507  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  63.52 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  62.4 
 
 		 406 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  59.19 
 
 		 416 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  64.12 
 
 		 396 aa  501  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  63.52 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  63.13 
 
 		 399 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  62.76 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  63.52 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3585  tryptophan synthase subunit beta  62.16 
 
 		 409 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  62.76 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2098  tryptophan synthase subunit beta  61 
 
 		 418 aa  502  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1297  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 		 399 aa  501  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.311384  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  61.44 
 
 		 401 aa  503  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  61.25 
 
 		 420 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  63.36 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  62.21 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0827  tryptophan synthase subunit beta  62.19 
 
 		 399 aa  501  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  63.13 
 
 		 399 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  62.88 
 
 		 400 aa  502  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  61.5 
 
 		 420 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  61.48 
 
 		 399 aa  504  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  63.17 
 
 		 404 aa  504  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  62.76 
 
 		 397 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  62.91 
 
 		 428 aa  503  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3270  tryptophan synthase subunit beta  62.16 
 
 		 409 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.244666 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  61.5 
 
 		 420 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  60.99 
 
 		 404 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 424 aa  499  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  62.63 
 
 		 412 aa  498  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>