More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2859 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2859  tryptophan synthase, beta subunit  100 
 
 
391 aa  787    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  63.52 
 
 
413 aa  498  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  63.52 
 
 
413 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  62.2 
 
 
399 aa  488  1e-137  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  63.49 
 
 
389 aa  486  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  62.09 
 
 
413 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 
415 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  63.49 
 
 
389 aa  486  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  62.3 
 
 
409 aa  481  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2098  tryptophan synthase subunit beta  64.03 
 
 
418 aa  484  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  63.17 
 
 
420 aa  483  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  61.32 
 
 
417 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  62.95 
 
 
404 aa  481  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  63.68 
 
 
409 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  61.77 
 
 
416 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  61.62 
 
 
418 aa  475  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  62.86 
 
 
411 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 
409 aa  475  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  61.66 
 
 
413 aa  475  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  61.32 
 
 
417 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27051  tryptophan synthase subunit beta  64.65 
 
 
421 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2255  tryptophan synthase subunit beta  61.44 
 
 
403 aa  472  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0836198 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2418  tryptophan synthase subunit beta  64.29 
 
 
418 aa  471  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0166  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 
414 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0594261  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  61.73 
 
 
414 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  63.95 
 
 
401 aa  473  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  61.14 
 
 
413 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2833  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 
395 aa  471  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 
401 aa  473  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  63.42 
 
 
399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01931  tryptophan synthase subunit beta  60.87 
 
 
414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  63.42 
 
 
399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 
391 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  61.82 
 
 
396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01841  tryptophan synthase subunit beta  60.45 
 
 
414 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  62.6 
 
 
393 aa  471  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 
405 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  61.08 
 
 
397 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 
397 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 
396 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  65.08 
 
 
406 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  63.68 
 
 
404 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  59.84 
 
 
397 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  61.08 
 
 
397 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 
397 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  61.08 
 
 
397 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  60.72 
 
 
397 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  59.32 
 
 
397 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  57.73 
 
 
389 aa  462  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  59.58 
 
 
397 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  59.58 
 
 
397 aa  463  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  59.58 
 
 
397 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  60.72 
 
 
397 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1586  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 
409 aa  463  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  56.59 
 
 
394 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  60.72 
 
 
397 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 
397 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1682  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 
407 aa  463  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  59.58 
 
 
397 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 
397 aa  461  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 
397 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  60.72 
 
 
397 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  59.58 
 
 
397 aa  463  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2916  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 
407 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.511307 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  60.72 
 
 
397 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0491  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 
399 aa  461  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1074  tryptophan synthase subunit beta  64.19 
 
 
425 aa  461  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.32093  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  56.36 
 
 
394 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2133  tryptophan synthase subunit beta  60.47 
 
 
397 aa  461  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.31152  normal  0.733883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  61.66 
 
 
403 aa  464  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  61.52 
 
 
417 aa  463  1e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  60.72 
 
 
397 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0827  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 
399 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  59.06 
 
 
397 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  59.84 
 
 
397 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  59.32 
 
 
394 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  56.36 
 
 
394 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  60.52 
 
 
408 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2207  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 
397 aa  461  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.823385  normal  0.0123051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  60.79 
 
 
400 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  60.47 
 
 
397 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0223  tryptophan synthase subunit beta  60.37 
 
 
388 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  60.78 
 
 
407 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  60.68 
 
 
399 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02292  tryptophan synthase subunit beta  59.18 
 
 
393 aa  458  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 
412 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3701  tryptophan synthase subunit beta  61.99 
 
 
396 aa  455  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1660  tryptophan synthase subunit beta  59.22 
 
 
396 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 
397 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2407  tryptophan synthase subunit beta  59.22 
 
 
396 aa  457  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  57.99 
 
 
406 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  58.7 
 
 
399 aa  457  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2705  tryptophan synthase subunit beta  58.96 
 
 
396 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2726  tryptophan synthase subunit beta  59.22 
 
 
396 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.93556  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2454  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 
401 aa  457  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02762  tryptophan synthase subunit beta  60.53 
 
 
396 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 
428 aa  455  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 
402 aa  457  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0140  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 
433 aa  454  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  61.66 
 
 
406 aa  454  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>