More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_69669 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  62.69 
 
 		 723 aa  939    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06290  tryptophan synthase, putative  53.71 
 
 		 715 aa  763    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.524376  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  52.71 
 
 		 671 aa  701    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  100 
 
 		 700 aa  1432    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2098  tryptophan synthase subunit beta  60.86 
 
 		 418 aa  497  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  60.47 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  60.68 
 
 		 403 aa  488  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  60.47 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  59.44 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  60.47 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  60.84 
 
 		 406 aa  486  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 402 aa  484  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  58.4 
 
 		 397 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  60.16 
 
 		 397 aa  485  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  59.48 
 
 		 391 aa  485  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  58.14 
 
 		 397 aa  482  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  59.42 
 
 		 397 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 397 aa  481  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  59.42 
 
 		 397 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  59.42 
 
 		 397 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 397 aa  482  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  59.48 
 
 		 409 aa  481  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 397 aa  481  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  59.42 
 
 		 397 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  57.99 
 
 		 405 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  59.27 
 
 		 409 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 401 aa  481  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  58.14 
 
 		 397 aa  480  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  59.42 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  59.42 
 
 		 397 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  61.52 
 
 		 394 aa  481  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  59.42 
 
 		 397 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  57.74 
 
 		 405 aa  476  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 414 aa  478  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 420 aa  476  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 416 aa  479  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  61.48 
 
 		 393 aa  477  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  59.06 
 
 		 409 aa  476  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  59.42 
 
 		 402 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  58.7 
 
 		 399 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  58.42 
 
 		 424 aa  474  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  56.67 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 396 aa  473  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  58.53 
 
 		 399 aa  475  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  56.67 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 394 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  58.53 
 
 		 399 aa  475  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 403 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12890  tryptophan synthase subunit beta  58.44 
 
 		 418 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal  0.0360199 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  58.12 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  58.46 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01841  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2418  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 418 aa  472  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0166  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 414 aa  472  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0594261  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  58.64 
 
 		 415 aa  472  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  59.02 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  57.51 
 
 		 403 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 404 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1261  tryptophan synthase subunit beta  58.18 
 
 		 404 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  57.89 
 
 		 424 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  57.66 
 
 		 406 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  56.66 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  58.46 
 
 		 406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 397 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  56.4 
 
 		 434 aa  472  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  56.97 
 
 		 406 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 411 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  58.07 
 
 		 399 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  57.85 
 
 		 403 aa  468  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  58.38 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  56.66 
 
 		 409 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 397 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  58.9 
 
 		 397 aa  468  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3585  tryptophan synthase subunit beta  56 
 
 		 409 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27051  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 421 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  58.21 
 
 		 413 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  58.55 
 
 		 418 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  58.97 
 
 		 415 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 404 aa  467  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  55.75 
 
 		 447 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  57.59 
 
 		 397 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 397 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1024  tryptophan synthase subunit beta  58.05 
 
 		 414 aa  467  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204551  hitchhiker  0.00011605 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 414 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  58.07 
 
 		 399 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  56.82 
 
 		 405 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  58.21 
 
 		 413 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3270  tryptophan synthase subunit beta  56 
 
 		 409 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.244666 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  57.85 
 
 		 399 aa  464  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  56.62 
 
 		 406 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0063  tryptophan synthase subunit beta  57.11 
 
 		 414 aa  464  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>