More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3297 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3297  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 265 aa  546  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.754487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3798  tryptophan synthase, alpha subunit  51.15 
 
 		 267 aa  293  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08026  tryptophan synthase alpha chain  56.38 
 
 		 253 aa  285  7e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3023  tryptophan synthase, alpha subunit  53.49 
 
 		 256 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64382  normal  0.04005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5480  tryptophan synthase, alpha subunit  55.43 
 
 		 278 aa  282  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.428541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1828  tryptophan synthase, alpha subunit  48.84 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4899  tryptophan synthase subunit alpha  51.95 
 
 		 253 aa  275  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  38.31 
 
 		 700 aa  190  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  39.42 
 
 		 258 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0840  tryptophan synthase subunit alpha  38.58 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0683  tryptophan synthase subunit alpha  37.35 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.550176 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0501  tryptophan synthase subunit alpha  36.95 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0623201  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0545  tryptophan synthase subunit alpha  35.69 
 
 		 270 aa  171  9e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153756  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1315  tryptophan synthase subunit alpha  37.2 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.52445  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  34.65 
 
 		 723 aa  170  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  36.21 
 
 		 260 aa  169  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  33.08 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  34.84 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  33.83 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  34.34 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  31.68 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0786  tryptophan synthase subunit alpha  34.96 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0265474  normal  0.221599 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  34.26 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  34.08 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  32.94 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  33.33 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  35.6 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  32.42 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  32.68 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  34.85 
 
 		 274 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  32.7 
 
 		 267 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  34.34 
 
 		 280 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  33.96 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  34.96 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  35.86 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  34.1 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  32.32 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  32.95 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  35.63 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  35.43 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1933  tryptophan synthase subunit alpha  36.44 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190779  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  32.68 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  32.68 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  36.73 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  31.13 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  35.22 
 
 		 266 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  31.52 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  35.83 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  33.58 
 
 		 280 aa  158  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  33.96 
 
 		 275 aa  158  8e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  33.59 
 
 		 269 aa  158  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  33.46 
 
 		 269 aa  158  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  33.97 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  35.37 
 
 		 256 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1308  tryptophan synthase subunit alpha  36.44 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000519792  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1255  tryptophan synthase subunit alpha  36.44 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00504507  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  36.73 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  34.02 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  33.88 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  33.99 
 
 		 269 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  33.08 
 
 		 269 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  33.08 
 
 		 269 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  34.69 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  36.33 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  33.88 
 
 		 258 aa  155  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  33.08 
 
 		 290 aa  155  8e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  33.88 
 
 		 258 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  33.88 
 
 		 258 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1362  tryptophan synthase subunit alpha  33.88 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  33.88 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  33.88 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  32.7 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  34.84 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  33.6 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  35.06 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  38.03 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  32.9 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  32.7 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1150  tryptophan synthase subunit alpha  33.47 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  33.21 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  34.66 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  32.81 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  34.54 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  35.63 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  34.57 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  33.47 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  33.88 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  32.69 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  34.35 
 
 		 265 aa  152  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4374  tryptophan synthase, alpha subunit  35.16 
 
 		 288 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  32.88 
 
 		 261 aa  153  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  34.73 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  32.81 
 
 		 272 aa  152  7e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  35.18 
 
 		 278 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  34 
 
 		 267 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  35.5 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  32.21 
 
 		 270 aa  151  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  34.55 
 
 		 265 aa  151  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  34.02 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>