More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3798 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3798  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 		 267 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4899  tryptophan synthase subunit alpha  55.98 
 
 		 253 aa  322  3e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1828  tryptophan synthase, alpha subunit  58.85 
 
 		 258 aa  317  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5480  tryptophan synthase, alpha subunit  61.45 
 
 		 278 aa  311  9e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.428541 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08026  tryptophan synthase alpha chain  52.9 
 
 		 253 aa  302  3.0000000000000004e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3297  tryptophan synthase subunit alpha  51.15 
 
 		 265 aa  293  3e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.754487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3023  tryptophan synthase, alpha subunit  50.77 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64382  normal  0.04005 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  38.55 
 
 		 276 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 264 aa  188  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  38.49 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  36.02 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  36.02 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  35.74 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  37.02 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  37.4 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  34.69 
 
 		 723 aa  175  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  35.52 
 
 		 263 aa  175  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  36.47 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  36.64 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  35.25 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  36.64 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  34.68 
 
 		 700 aa  171  7.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  38.06 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  34.59 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  35.1 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  35.1 
 
 		 280 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  36.89 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  35.6 
 
 		 261 aa  169  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  35.1 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  35.08 
 
 		 302 aa  167  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  33.08 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  36.12 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  36.51 
 
 		 671 aa  166  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  37.14 
 
 		 250 aa  165  9e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  36.86 
 
 		 268 aa  164  9e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  36.86 
 
 		 268 aa  164  9e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  37.45 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  33.21 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0683  tryptophan synthase subunit alpha  36.14 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.550176 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  34.35 
 
 		 271 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1315  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 267 aa  162  7e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.52445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  32.33 
 
 		 267 aa  162  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0501  tryptophan synthase subunit alpha  36.11 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0623201  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  36.89 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  35.52 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  34.98 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  36.78 
 
 		 267 aa  158  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  34.21 
 
 		 267 aa  158  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  38.62 
 
 		 277 aa  158  7e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  34.59 
 
 		 265 aa  158  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  34.11 
 
 		 259 aa  158  8e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  34.26 
 
 		 272 aa  158  9e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  36.5 
 
 		 273 aa  158  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0545  tryptophan synthase subunit alpha  37.77 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153756  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  36.68 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  33.97 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  36.84 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  35.71 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  34.6 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  33.86 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  34.43 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  34.22 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  36.03 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  35.63 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  32.43 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01272  tryptophan synthase subunit alpha  37.7 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  33.97 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  33.96 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  35.48 
 
 		 265 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  34.22 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  34.02 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  35.85 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  34.22 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  34.35 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  34.35 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  33.83 
 
 		 275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2466  tryptophan synthase subunit alpha  34.51 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  34.22 
 
 		 258 aa  155  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0840  tryptophan synthase subunit alpha  34.63 
 
 		 267 aa  155  9e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1150  tryptophan synthase subunit alpha  33.46 
 
 		 258 aa  155  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  35.39 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  32.7 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  34.36 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  35.51 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  37.3 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0854  tryptophan synthase, alpha subunit  34.94 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  34.08 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0786  tryptophan synthase subunit alpha  35.14 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0265474  normal  0.221599 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  35.27 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  36.65 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1933  tryptophan synthase subunit alpha  38.6 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190779  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  35.48 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1536  tryptophan synthase subunit alpha  33.76 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.201624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  35.91 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  34.85 
 
 		 270 aa  152  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  36.03 
 
 		 277 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  36.95 
 
 		 278 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>