More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0786 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0786  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0265474  normal  0.221599 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0683  tryptophan synthase subunit alpha  77.53 
 
 		 267 aa  429  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.550176 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0840  tryptophan synthase subunit alpha  73.78 
 
 		 267 aa  426  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1933  tryptophan synthase subunit alpha  73.78 
 
 		 267 aa  408  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190779  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0501  tryptophan synthase subunit alpha  69.29 
 
 		 267 aa  403  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0623201  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1315  tryptophan synthase subunit alpha  69.66 
 
 		 267 aa  397  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.52445  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0545  tryptophan synthase subunit alpha  70.57 
 
 		 270 aa  394  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153756  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  37.22 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  38.85 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  36.84 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  36.88 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1828  tryptophan synthase, alpha subunit  37.05 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  37.84 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3023  tryptophan synthase, alpha subunit  34.09 
 
 		 256 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64382  normal  0.04005 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  36.5 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  35.56 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  37.7 
 
 		 269 aa  168  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4899  tryptophan synthase subunit alpha  33.6 
 
 		 253 aa  168  9e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  34.7 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  36.51 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  39.36 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  36.19 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  40.83 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  34.67 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  38.49 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  36.3 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3297  tryptophan synthase subunit alpha  34.96 
 
 		 265 aa  166  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.754487 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  38.46 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  36.72 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  37.98 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  37.64 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  36.36 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08026  tryptophan synthase alpha chain  33.21 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  34.31 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  34.2 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  39.2 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  36.21 
 
 		 278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  35.45 
 
 		 265 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  34.48 
 
 		 700 aa  162  8.000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  37.27 
 
 		 278 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  37.93 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  36.08 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  38.11 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  37.08 
 
 		 278 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  33.21 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  36.15 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  39.17 
 
 		 275 aa  158  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  37.65 
 
 		 278 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  36.64 
 
 		 267 aa  158  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  35.27 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  35.58 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  34.7 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  37.36 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  38.33 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  34.73 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  37.34 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  36.33 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  35.5 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  34.35 
 
 		 267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  37.7 
 
 		 278 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  39.26 
 
 		 268 aa  155  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  39.26 
 
 		 268 aa  155  8e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  37.6 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  36.73 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  33.84 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  35.08 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  40.91 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  32.12 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  34.4 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  34.87 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  35.2 
 
 		 272 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06290  tryptophan synthase, putative  35.59 
 
 		 715 aa  154  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.524376  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  33.98 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  35.46 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  35.25 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3798  tryptophan synthase, alpha subunit  35.14 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  36.02 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  34.23 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  34.84 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  36.4 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  36.76 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  34.5 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  32.79 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  36.44 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3190  tryptophan synthase, alpha subunit  36.11 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  32.81 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  36.51 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  35.06 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  36.76 
 
 		 261 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  34.8 
 
 		 272 aa  152  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  36.23 
 
 		 269 aa  152  8e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  36.06 
 
 		 274 aa  152  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  34.92 
 
 		 269 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  34.69 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  35.11 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  35.38 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  36.99 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  34.92 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>